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由于急性髓系白血病(AML)是一種異質(zhì)性疾病，存在于復(fù)雜的微環(huán)境中，使得了解不同細(xì)胞類型對該疾病影響的研究變得復(fù)雜。為了探究其機(jī)理并作為醫(yī)學(xué)參考，來自哈佛醫(yī)學(xué)院的Bradley E. Bernstein研究團(tuán)隊(duì)在Cell雜志（IF=24.38）上發(fā)表了題為“單細(xì)胞RNA測序技術(shù)揭示與疾病進(jìn)展和免疫相關(guān)的急性髓系白血病分型”（Single-Cell RNA-Seq Reveals AML Hierarchies Relevant to Disease Progression and Immunity）的學(xué)術(shù)論文。該工作分三個(gè)步驟對急性髓系白血病患者的單個(gè)細(xì)胞進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組學(xué)和基因突變結(jié)合分析。

第一步，該研究將單細(xì)胞RNA測序和基因分型相結(jié)合，對40例骨髓標(biāo)本中的38410個(gè)細(xì)胞進(jìn)行了分析，其中包括16例AML患者和5例健康捐贈(zèng)者；第二步使用機(jī)器學(xué)習(xí)分類器來區(qū)分惡性細(xì)胞類型的光譜，這些惡性細(xì)胞類型的豐度在不同患者之間和同一腫瘤的亞克隆種類之間都有所不同；第三步根據(jù)得到圖譜結(jié)果，發(fā)現(xiàn)其存在明顯的功能亞群和相關(guān)驅(qū)動(dòng)因素。

研究表明，細(xì)胞類型組成與原型遺傳病變相關(guān)，原始AML細(xì)胞表現(xiàn)出轉(zhuǎn)錄程序異常，同時(shí)表達(dá)干細(xì)胞和髓細(xì)胞啟動(dòng)基因。分化的單核細(xì)胞樣AML細(xì)胞在體外表達(dá)多種免疫調(diào)節(jié)基因并抑制T細(xì)胞活性。該研究提供相關(guān)單細(xì)胞技術(shù)和包括AML細(xì)胞狀態(tài)、調(diào)節(jié)因子和標(biāo)記物的圖譜，為精準(zhǔn)醫(yī)療和免疫治療提供參考。

該研究有助于深入了解原始AML細(xì)胞異常的調(diào)控機(jī)制，揭示其發(fā)育層次與腫瘤遺傳學(xué)之間驚人的一致性，同時(shí)識別出具有免疫抑制特性的分化AML細(xì)胞，該研究還可以指導(dǎo)針對惡性腫瘤關(guān)鍵特異性成分的治療策略。

原文鏈接：

https://doi.org/10.1016/j.cell.2019.01.031