
第五章數(shù)字病理
第一節(jié):概述
1. 數(shù)字病理原理
數(shù)字化病理切片數(shù)字病理切片(digital slide of pathology)又稱虛擬病理切片(vitual slide of pathology),是一種現(xiàn)代數(shù)字系統(tǒng)與傳統(tǒng)光學(xué)放大裝置有機(jī)結(jié)合的技術(shù)。它是將傳統(tǒng)的玻璃病理切片通過全自動顯微鏡或光學(xué)放大系統(tǒng)掃描采集得到高分辨數(shù)字圖像,再應(yīng)用計算機(jī)對得到的圖像自動進(jìn)行高精度多視野無縫隙拼接和處理,獲得優(yōu)質(zhì)的可視化數(shù)據(jù)以應(yīng)用于病理學(xué)的各個領(lǐng)域。
數(shù)字病理系統(tǒng)主要由數(shù)字切片掃描裝置和數(shù)據(jù)處理軟件構(gòu)成。首先,利用數(shù)字顯微鏡或放大系統(tǒng)在低倍物鏡下對玻璃切片進(jìn)行逐幅掃描采集成像,顯微掃描平臺自動按照切片XY軸方向掃描移動,并在Z軸方向自動聚焦。然后,由掃描控制軟件在光學(xué)放大裝置有效放大的基礎(chǔ)上利用程控掃描方式采集高分辨數(shù)字圖像,圖像壓縮與存儲軟件將圖像自動進(jìn)行無縫拼接處理,制作生成整張全視野的數(shù)字化切片(Whole Slide Image, 簡稱WSI)。再將這些數(shù)據(jù)存儲在一定介質(zhì)中建立起數(shù)字病理切片庫。隨后就可以利用相應(yīng)的數(shù)字病理切片瀏覽系統(tǒng),對一系列可視化數(shù)據(jù)進(jìn)行任意比例放大或縮小以及任意方向移動的瀏覽和分析處理,就好比在操作一臺真實的光學(xué)顯微鏡一樣。
該技術(shù)可以幫助病理醫(yī)生擺脫傳統(tǒng)顯微鏡的約束,隨時隨地通過互聯(lián)網(wǎng)進(jìn)行醫(yī)學(xué)診斷上的交流,實現(xiàn)全球化在線實時遠(yuǎn)程會診或離線遠(yuǎn)程會診。由于該系統(tǒng)可以支持全切片立體信息,使得分析過程等同于傳統(tǒng)顯微鏡的肉眼觀察,其在空間和時間變換等方面具有突出優(yōu)點。
2. 技術(shù)分類
從圖像采集原理上劃分,可以分為面陣CCD和線陣CCD采集設(shè)備。
2.1 面陣CCD掃描
能夠直觀地對視場中的圖像進(jìn)行觀察。但單個視野的面陣成像要遍歷整個切片,通過拼接全部“方塊”視野后才形成大視野的虛擬切片,因此存在處理數(shù)據(jù)量大,容易造成拼接錯誤、速度慢等缺點。
面陣圖像傳感器配合切片的掃描,具體是切片移動一個視場后,停下來等面陣圖像傳感器曝光,曝光結(jié)束后再移動至下一個視場,依此類推,獲得多個連續(xù)視場的圖像數(shù)據(jù),最后拼接成全視場的圖像。該方法具有實現(xiàn)簡單,但切片需要走走停停,而且停止后還需再等待一段時間,確保切片穩(wěn)定后再開始曝光,因而速度比較慢。
2.2 線陣CCD掃描
線陣圖像傳感器配合切片的勻速運(yùn)動,一般稱為線掃方式,其在掃描時,切片是保持勻速運(yùn)動,速度很快,但是控制復(fù)雜,要求載物臺的控制精度高,并需要有輔助的對焦裝置,系統(tǒng)成本高。面陣掃描在追求掃描速度的同時,更在意的是掃描后的圖像質(zhì)量。而面陣傳感器面積大,可收集更多的光,這一優(yōu)勢在熒光掃描中,能明顯地體現(xiàn)出來。
第二節(jié):數(shù)字病理發(fā)展歷程及應(yīng)用
1.數(shù)字病理的發(fā)展和演變
以玻璃切片和顯微鏡為基礎(chǔ)的病理學(xué)技術(shù),至今已經(jīng)發(fā)展了200多年。
最近幾十年,隨著計算機(jī)和信息技術(shù)的迅速發(fā)展,數(shù)字病理學(xué)應(yīng)運(yùn)而生。
數(shù)字病理學(xué),簡單來說,就是將傳統(tǒng)病理切片轉(zhuǎn)化成數(shù)字圖像,上傳到計算機(jī)查看,這是數(shù)字病理學(xué)最早的模式。從單張2D虛擬切片開始,到包含多張?zhí)摂M切片的虛擬病例,是數(shù)字病理學(xué)最初的嘗試。然而從那以后,數(shù)字病理學(xué)的概念和功能逐步發(fā)生巨大改變,當(dāng)前對它更準(zhǔn)確的定義是:組織學(xué)和為組織學(xué)病理信息系統(tǒng)。這類系統(tǒng)不僅實現(xiàn)樣品數(shù)字可視化,也實現(xiàn)了對2D/3D樣品的數(shù)字化管理,譬如實時評估、比較、2D/3D重建、歸檔;大范圍地傳播查看和咨詢;與其他病人資料進(jìn)行匯編、數(shù)據(jù)挖掘;以及用于教育、臨床診斷、病人管理研究和發(fā)展人工智能工具等等。
上世紀(jì)60年代,有科學(xué)家進(jìn)行了嘗試。80年代,開始使用模擬或數(shù)字?jǐn)z像頭進(jìn)行圖像采集、存儲和傳輸。到80年代末,有人提出將整張切片數(shù)字化的設(shè)想。該設(shè)想一提出就在歐美涌現(xiàn)出競相研發(fā)的熱潮。上世紀(jì)90年代,首套數(shù)字病理切片系統(tǒng)在美國研發(fā)成功,并應(yīng)用于商業(yè)領(lǐng)域。
2. 數(shù)字病理切片的特點
2.1 可以永久保存,方便管理檢索。
傳統(tǒng)玻璃切片在制作和使用過程中容易破碎、褪色,標(biāo)本消耗量大;一些珍貴標(biāo)本取材不易,一旦破損,難以補(bǔ)充;熒光切片易淬滅不宜長久保存……數(shù)字切片克服了這些缺點,既可以永久保存,又無需大量重復(fù)制作,節(jié)約資源。
玻璃切片數(shù)字化之后,便于進(jìn)行標(biāo)記,分類保存,方便檢索,使切片的管理更加高效便捷。利用數(shù)字切片建立超大容量的數(shù)字病理切片庫,保存珍貴的切片資料,并且實現(xiàn)了同一張切片可在不同地點同時被很多人瀏覽。
2.2 隨時瀏覽,便于標(biāo)記。
與傳統(tǒng)玻璃切片依賴顯微鏡進(jìn)行觀察不同,數(shù)字切片可以隨時隨地通過調(diào)閱電腦切片庫里進(jìn)行瀏覽閱讀。
玻璃切片在顯微鏡下觀察,遇到典型結(jié)構(gòu),定位標(biāo)記比較困難,一旦移動視野就要重新再尋找典型結(jié)構(gòu)。數(shù)字切片是一個電子文檔,在觀察切片時可以把典型結(jié)構(gòu)進(jìn)行標(biāo)記,日后需要查閱,只需單擊屏幕上的典型結(jié)構(gòu)快捷按鈕,標(biāo)記位置立即重現(xiàn),無論是教學(xué)的復(fù)習(xí),還是診斷的復(fù)核都非常方便。
2.3 方便傳輸,為教學(xué)和遠(yuǎn)程會診提供便利。
網(wǎng)絡(luò)技術(shù)的發(fā)展使得數(shù)字切片可以高速高效地傳輸。
數(shù)字切片庫用網(wǎng)絡(luò)進(jìn)行遠(yuǎn)程傳輸和資源共享, 學(xué)生可隨時通過網(wǎng)絡(luò)系統(tǒng), 以模擬顯微鏡的方式瀏覽和觀察數(shù)據(jù)資源庫的切片,使教學(xué)活動延伸到課堂之外。
采用數(shù)字切片,專家遠(yuǎn)程實時閱片,避免過去病理切片寄送中發(fā)生玻璃切片破碎、丟失或其他醫(yī)療安全隱患,同時及時進(jìn)行多方會診。
2.4 優(yōu)質(zhì)圖像包含切片全部信息。
日益發(fā)展的數(shù)字切片掃描系統(tǒng),掃描獲得高分辨率和清晰度的圖像。
在鼠標(biāo)操縱下選擇數(shù)字切片任意位置完成無極變倍連續(xù)縮放瀏覽,并提供切片全景導(dǎo)航,使高倍鏡下的圖像與低倍鏡下的位置形成良好對應(yīng)。還能夠?qū)崿F(xiàn)切片的定量分析和標(biāo)注等后期處理。
應(yīng)用者可對顯微切片任何區(qū)域進(jìn)行不同放大倍率的瀏覽,瀏覽時為光學(xué)放大而非數(shù)碼放大,因此不存在圖像信息失真和細(xì)節(jié)不清的問題,這與普通計算機(jī)瀏覽圖片縮放只改變圖像大小而無法改變分辨率有本質(zhì)的區(qū)別。
3. 數(shù)字病理切片應(yīng)用現(xiàn)狀
3.1形態(tài)學(xué)學(xué)科的教學(xué)工具
作為一種新的突破性技術(shù),數(shù)字病理切片已經(jīng)給病理學(xué)等形態(tài)學(xué)學(xué)科的教學(xué)帶來革命性變化。澳大利亞新南威爾士大學(xué)早在2004年就首次成功的將數(shù)字切片系統(tǒng)應(yīng)用于病理學(xué)教學(xué)與考試的累積性評估。
醫(yī)院、學(xué)校、研究機(jī)構(gòu)整理典型病例和疑難病例切片,挑選制作精良、圖像清晰的玻璃切片掃描成數(shù)字切片,建立數(shù)字病理切片庫。病變組織掃描后可以永久使用,能夠避免教學(xué)組織切片的不斷損耗。全數(shù)字化存儲,不占空間。
根據(jù)特征、疾病、癥狀、解破部位等對數(shù)字病理切片進(jìn)行分類檢索和查詢,在展示病變組織的同時對照正常圖像,加強(qiáng)學(xué)生的縱向和橫向思維的鍛煉,更準(zhǔn)確地理解某些抽象概念。不僅提高教學(xué)資源的使用效率,豐富了教學(xué)內(nèi)容,同時方便教學(xué)資源的管理。對本科生、研究生及臨床醫(yī)生的教學(xué)培訓(xùn)起了關(guān)鍵作用。
將數(shù)字病理切片上傳到服務(wù)器端,通過網(wǎng)絡(luò)傳輸,應(yīng)用于講座教學(xué)和集體閱片。通過圖像瀏覽軟件進(jìn)行觀察,用鼠標(biāo)選擇切片任意位置,進(jìn)行定倍及任意倍率的放大或縮小,不產(chǎn)生圖像信息失真。進(jìn)行網(wǎng)上教學(xué),不同地點的人可以共同探討和發(fā)表意見,不受時間空間限制。
3.2 臨床疾病的診斷助手
3.2.1 遠(yuǎn)程診斷
病理遠(yuǎn)程診斷于1973年首次應(yīng)用于臨床,從一艘停泊在巴西的輪船通過衛(wèi)星遠(yuǎn)距離向華盛頓傳送骨髓涂片的病理圖像。1987年,美國Rush醫(yī)學(xué)院病理科Weinstein首次提出利用遠(yuǎn)程醫(yī)學(xué)開展病理會診。目前,遠(yuǎn)程病理診斷已在歐美、日本的病理診斷中得到廣泛應(yīng)用。德國已經(jīng)實現(xiàn)利用數(shù)字病理系統(tǒng)進(jìn)行乳腺癌遠(yuǎn)程診斷。
病理遠(yuǎn)程診斷是通過數(shù)字切片掃描系統(tǒng),在高倍物鏡下,把整張病理切片快速掃描生成全視野數(shù)字病理切片后存儲在電腦里,醫(yī)院或患者通過網(wǎng)絡(luò),將數(shù)字病理切片與相關(guān)病史上傳到診斷平臺。專家登錄平臺,通過瀏覽器進(jìn)行數(shù)字切片瀏覽、分析和診斷,對病人的病情進(jìn)行討論,進(jìn)一步明確診斷,指導(dǎo)確定治療方案。專家診斷或會診結(jié)束后,系統(tǒng)可自動下載專家診斷報告,并打印。
這套系統(tǒng)實現(xiàn)了患者、醫(yī)院、專家之間遠(yuǎn)程診斷信息的及時傳遞,使病理醫(yī)生、臨床醫(yī)生在最短的時間內(nèi)取得診斷報告(被譽(yù)為腫瘤診斷的“金標(biāo)準(zhǔn)”),使患者得到及時的救治。特別適合于冰凍切片遠(yuǎn)程診斷。
此外,這套系統(tǒng)架起了專家與基層醫(yī)院、病理科醫(yī)生會診、咨詢、討論的橋梁,可以實現(xiàn)無時間、空間限制的快速的遠(yuǎn)程病理會診和咨詢業(yè)務(wù),緩解因醫(yī)療資源分配不均造成的一系列問題。
3.2.2 診斷中的質(zhì)量控制
病理診斷是鑒定腫瘤良、惡性唯一“金標(biāo)準(zhǔn)”,準(zhǔn)確縝密的病理診斷是決定臨床手術(shù)、治療方案的重要依據(jù)。病理診斷涉及的環(huán)節(jié)眾多,任何一個節(jié)點出現(xiàn)問題,即可能引起診斷失誤。因而病理診斷的每一個環(huán)節(jié)都應(yīng)該進(jìn)行質(zhì)量控制。包括:
( 1) 診斷前質(zhì)控: 主要對標(biāo)本的接收和固定、取材、制片等環(huán)節(jié)進(jìn)行質(zhì)控。
( 2) 診斷中質(zhì)控: 主要對診斷過程中的審核、醫(yī)囑提醒、病理報告、標(biāo)本質(zhì)量進(jìn)行質(zhì)控。
( 3) 診斷后質(zhì)控: 主要對切片借閱、病例歸檔、查詢統(tǒng)計進(jìn)行質(zhì)控。
傳統(tǒng)質(zhì)量控制,需要到現(xiàn)場查看制片結(jié)果。
采用數(shù)字化病理后,即可遠(yuǎn)程基于通過全視野數(shù)字病理切片對制片質(zhì)量以及診斷質(zhì)量進(jìn)行評價。通過遠(yuǎn)程病理質(zhì)控,直接修訂存在問題的病理診斷。
3.2.3計算機(jī)輔助病理診斷
隨著全視野數(shù)字切片掃描技術(shù)的不斷進(jìn)步與發(fā)展,由數(shù)字病理拓展而來的臨床應(yīng)用越來越廣泛。數(shù)字病理應(yīng)用于病理圖像深度分析協(xié)助病理診斷將在未來依賴人工智能的發(fā)展程度,然而這是我國乃至世界方興未艾的領(lǐng)域,也是未來數(shù)字病理發(fā)展的重要方向。
(1)自動圖像分析提高組織病理學(xué)的診斷效率。采用全視野數(shù)字切片進(jìn)行診斷時,進(jìn)行圖像瀏覽的時間可能比傳統(tǒng)顯微鏡有所增加。通過編寫程序來識別感興趣區(qū)域(ROI)可以改善并加速診斷工作流程,特別是如果能在病理醫(yī)生看到圖像前就計算出ROI就更有意義。
(2)對于免疫組織化學(xué)染色的全視野數(shù)字切片進(jìn)行定量分析軟件可以提高分析的準(zhǔn)確性。軟件通過對照細(xì)胞的染色強(qiáng)度來進(jìn)行評價,比肉眼觀察有更高的穩(wěn)定性和準(zhǔn)確性。
麥克奧迪實業(yè)集團(tuán)、Ventana醫(yī)療系統(tǒng)公司等都推出針對免疫組織化學(xué)染色圖像自動分析的軟件,如Her2病理圖像分析軟件,Ki67病理圖像分析軟件,p53病理圖像分析軟件等。
3.3科學(xué)研究
3.3.1 醫(yī)學(xué)研究中的應(yīng)用
全視野數(shù)字切片可以對病變進(jìn)行精準(zhǔn)的測量,比光學(xué)顯微鏡下直接測量或測量照片獲得更準(zhǔn)確地結(jié)果。很多醫(yī)學(xué)研究都需要對病理切片進(jìn)行多中心的評價。通過全視野數(shù)字切片可以方便地提供切片共享,以及歸檔管理。
3.3.2 病理學(xué)研究中的應(yīng)用
組織芯片TMA、藥物篩選、毒理實驗室、法醫(yī)鑒定、刑事微物鑒別等。
以往,病理圖像研究僅限于記錄與測量,較少進(jìn)行分析。而數(shù)字化病理切片,可以在切片數(shù)字化基礎(chǔ)上進(jìn)行圖像分析。比如通過軟件對腫瘤組織免疫組織化學(xué)染色情況進(jìn)行分析,把染色強(qiáng)弱、陽性比例等進(jìn)行統(tǒng)計,得出全片的結(jié)果。比人工評價、手工統(tǒng)計更方便、準(zhǔn)確。目前對于標(biāo)記在細(xì)胞核或細(xì)胞膜上的自動免疫組化(IHC)染色已經(jīng)有了成熟的解決方案,比如ER、PR、Her-2等。
組織微陣列(TMA)作為大通量病理組織形態(tài)的研究手段,已經(jīng)在病理研究中普遍使用。WSI掃描TMA切片后,軟件進(jìn)行分割,逐一提取TMA組織,再進(jìn)行統(tǒng)計分析計算,大大降低了人力成本,而且保證結(jié)果更真實可靠。
應(yīng)用病理遠(yuǎn)程診斷平臺,可以實現(xiàn)切片制作、存儲和管理的數(shù)字化,通過醫(yī)院PACS/HIS接口,共享全球數(shù)字化病理信息;實現(xiàn)教學(xué)、科研、診斷以及遠(yuǎn)程病理質(zhì)控的網(wǎng)絡(luò)信息化,使各地醫(yī)院(同城或異地醫(yī)院)可進(jìn)行學(xué)術(shù)交流和互聯(lián)網(wǎng)絡(luò)會議等。
第三節(jié):主要生產(chǎn)企業(yè)及概況
1. 國內(nèi)主要廠家
(1)麥克奧迪實業(yè)集團(tuán)有限公司
創(chuàng)立于1983年,已成功地在美國、加拿大、德國、西班牙、英國、香港和中國等多個國家注冊了motic商標(biāo)。近幾年來,MOTIC將現(xiàn)代科技與醫(yī)療診斷技術(shù)結(jié)合,把傳統(tǒng)顯微鏡變?yōu)椤皵?shù)碼顯微圖像處理系統(tǒng)”的分支平臺。數(shù)碼互動教室、實驗室的首創(chuàng)和推出,掀起了形態(tài)教學(xué)的革命。自動顯微鏡系統(tǒng)的成功研發(fā)為顯微科學(xué)領(lǐng)域的研究和發(fā)展提供了嶄新的理念和實用平臺,推動了遠(yuǎn)程醫(yī)療、遠(yuǎn)程科研和遠(yuǎn)程教學(xué)的廣泛應(yīng)用。
由麥克奧迪自主研發(fā)的EasyScan系列的數(shù)字切片掃描系統(tǒng),有四種掃描方式應(yīng)用于不同標(biāo)本:標(biāo)準(zhǔn)掃描;高精度掃描;多層掃描;景深擴(kuò)展掃描。該系統(tǒng)切片掃描圖像清晰、瀏覽快速、操作簡便,與遠(yuǎn)程平臺技術(shù)相結(jié)合,可作為病理遠(yuǎn)程會診咨詢、病理診斷的質(zhì)控、病理數(shù)字化建設(shè)、教學(xué)、培訓(xùn)及考核等方面的工具使用,對病理診斷水平較薄弱的基層醫(yī)療機(jī)構(gòu)更具有實用價值,對提升我國醫(yī)院的病理診斷水平具有重要深遠(yuǎn)的意義。
由麥克奧迪實業(yè)集團(tuán)有限公司、加拿大不列顛哥倫比亞腫瘤研究院(BCCA)合資建立的麥克奧迪(廈門)醫(yī)療診斷系統(tǒng)有限公司。2011年麥克奧迪(廈門)醫(yī)療診斷系統(tǒng)有限公司為國家衛(wèi)生計生委搭建中國數(shù)字病理遠(yuǎn)程診斷與質(zhì)控平臺,F(xiàn)已覆蓋全國近1000家醫(yī)院,每年為醫(yī)院解決疑難病例會診2萬多列,該平臺成為全球運(yùn)行最有效的遠(yuǎn)程病理會診平臺之一。
自主開發(fā)的Gallery數(shù)字切片云存儲平臺,可應(yīng)用于存儲和瀏覽個人數(shù)字切片,針對病例進(jìn)行分享和討論,以及有價值病里數(shù)字切片有償使用;作為病理科內(nèi)部數(shù)字切片系統(tǒng),提供數(shù)字切片的存儲、管理、應(yīng)用解決方案,可應(yīng)用于院內(nèi)與臨床的討論;作為第三方會診系統(tǒng)數(shù)字切片支持,輸入多個廠家數(shù)字切片問價格式,開放的API方便與第三方遠(yuǎn)程會診系統(tǒng)進(jìn)行集成。
廈門麥克奧迪病理細(xì)胞診斷中心(以下簡稱中心)是由麥克奧迪(廈門)醫(yī)療診斷系統(tǒng)有限公司全額投資,并經(jīng)國家衛(wèi)生行政主管機(jī)關(guān)批準(zhǔn)的獨立病理細(xì)胞診斷中心,能自主開展臨床病理、細(xì)胞學(xué)診斷,獨立于臨床之外的第三方實驗室。中國工程院院士、著名病理學(xué)家劉彤華教授為本中心首席專家。中心日常坐診專家(教授、主任醫(yī)師)3人,醫(yī)師2人,技術(shù)員3人。
作為中華醫(yī)學(xué)會婦科腫瘤分會、中國宮頸癌防治工程和中國健康扶貧工程組委會的戰(zhàn)略合作伙伴,廈門麥克奧迪病理細(xì)胞診斷中心在全國范圍內(nèi)廣泛開展宮頸癌普查和其他腫瘤的早期診斷工作,積累了豐富的實踐經(jīng)驗。
(2)北京優(yōu)納科技有限公司
成立于2005年8月,是由海外歸國留學(xué)人員創(chuàng)辦的高新技術(shù)企業(yè)。業(yè)務(wù)領(lǐng)域包括基于“數(shù)字病理遠(yuǎn)程會診”一體化解決方案的醫(yī)學(xué)影像領(lǐng)域和基于機(jī)器視覺產(chǎn)品及解決方案的半導(dǎo)體及工業(yè)檢測領(lǐng)域,具體內(nèi)容包括半導(dǎo)體、平板電子、SMT等自動化光學(xué)檢測設(shè)備的研發(fā)、生產(chǎn)、銷售以及數(shù)字病理及遠(yuǎn)程病理相關(guān)產(chǎn)品研發(fā)及服務(wù)。
優(yōu)納科技是國家高新技術(shù)企業(yè)、軟件企業(yè)、北京中關(guān)村百家試點企業(yè)、火炬計劃實施企業(yè),通過了ISO9000、ISO13485等一系列管理體系認(rèn)證。自2005年成立以來,優(yōu)納科技依托自身強(qiáng)大的技術(shù)開發(fā)能力以及創(chuàng)新能力,研究開發(fā)出PHOCUS-G系列高速千兆網(wǎng)工業(yè)相機(jī)、RAPID系列全自動全光學(xué)檢測設(shè)備、KIS系列平板電子產(chǎn)品檢測系統(tǒng)、PRECICE系列全自動數(shù)字切片掃描系統(tǒng)等擁有自主知識產(chǎn)權(quán)的軟硬件產(chǎn)品。其中多項產(chǎn)品被北京市授予“自主創(chuàng)新產(chǎn)品”稱號,入選政府采購產(chǎn)品目錄。在知識產(chǎn)權(quán)方面,優(yōu)納科技已擁有發(fā)明專利二十余項,軟件著作權(quán)認(rèn)證四十余項。
(3)寧波江豐生物信息技術(shù)有限公司
寧波江豐生物信息技術(shù)有限公司坐落于具有七千年歷史文化沉淀的浙江省余姚市,是一家專業(yè)從事數(shù)字病理系統(tǒng)開發(fā)和生產(chǎn)的高科技生物信息技術(shù)企業(yè)。公司成立于2011年8月,注冊資本1000萬元人民幣。
數(shù)字病理綜合診斷系統(tǒng)作為公司核心產(chǎn)品,是以高精度數(shù)字化病理切片掃描儀代替?zhèn)鹘y(tǒng)的顯微鏡,實現(xiàn)傳統(tǒng)病理切片的數(shù)字信息化,并利用獨自的醫(yī)療影像處理技術(shù)進(jìn)行智能化病理分析和診斷,同時建立起數(shù)字病理圖像數(shù)據(jù)庫并實現(xiàn)病理診斷信息的遠(yuǎn)程共享。該系統(tǒng)將現(xiàn)代醫(yī)學(xué)、自動控制技術(shù)、醫(yī)療圖像處理技術(shù)、計算機(jī)網(wǎng)絡(luò)技術(shù)、現(xiàn)代通信技術(shù)等高科技融為一體,最終形成一個醫(yī)療、教育、科研以及信息服務(wù)為一體的解決平臺。
2.國外主要廠家
(1)德國萊卡Aperio
2012年,萊卡正式收購Aperio。萊卡可以利用遍布世界各國的終端銷售網(wǎng)絡(luò)為數(shù)字病理掃描儀開路,同時發(fā)揮aperio的在數(shù)字病理掃描儀方面的高端技術(shù),享受aperio在數(shù)字病理掃描行業(yè)的15年的成熟研發(fā)成果。這是目前技術(shù)最成熟的數(shù)字病理掃描系統(tǒng),但是價格昂貴。
(2)日本濱松Hamamatsu
成立于1953年的日本濱松光子學(xué)株式會社(以下簡稱濱松集團(tuán)),是一家高水平的光科學(xué)、光產(chǎn)業(yè)公司。濱松集團(tuán)的產(chǎn)品被廣泛的應(yīng)用在醫(yī)療生物、高能物理、宇宙探測、精密分析等產(chǎn) 業(yè)領(lǐng)域,是光產(chǎn)業(yè)界的領(lǐng)軍企業(yè)。為了更好的貢獻(xiàn)于中國光產(chǎn)業(yè),緊跟中國十二五規(guī)劃的步伐,在2011年10月 成立“濱松光子學(xué)商貿(mào)(中國)有限公司”。
自2003年推出第一款數(shù)字切片掃描儀以來,濱松數(shù)字切片掃描儀NanoZoomer家族不斷壯大,推出包括NanoZoomer-SQ, NanoZoomer-HT, NanoZoomer-RS以及NanoZoomer-XR型號產(chǎn)品。
(3)3DHistech
3DHISTECH,創(chuàng)立于1996年,總部位于匈牙利首都布達(dá)佩斯,專業(yè)從事數(shù)字切片掃描系統(tǒng)和全自動組織芯片系統(tǒng)的研發(fā)、生產(chǎn)和經(jīng)營。公司自1999年成功推出了世界上第一臺Marix機(jī)器后的十余年,分別推出了Pannoramic系列數(shù)字切片掃描系統(tǒng)和MA全自動組織芯片系統(tǒng),并取得了美國及歐盟百余種專利技術(shù)。
Pannoramic系列有三種掃描方式:單層掃描,掃描時間短,所需存儲空間最小,適用于明場或IF(免疫熒光)切片掃描;多層掃描,掃描后將每層圖像分別保存和瀏覽,掃描時間長,所需存儲空間大;深擴(kuò)展掃描,也就是多層融合掃描,是將自動聚焦多層掃描的功能得到了更深的擴(kuò)展,它可實現(xiàn)多層圖像的融合,時間長,但所需存儲空間小,特別適合FISH切片掃描。
除了數(shù)字切片掃描軟件、數(shù)字切片瀏覽軟件為與PANNORAMIC相配套的兩個基本功能軟件外,3D還有多種可選配的專項分析軟件,例如組織定量分析軟件,適用于明場及熒光圖像分析,同時可以應(yīng)用于細(xì)胞學(xué)或血液學(xué)的定量分析、胚胎學(xué)組織分割的定量分析等。
(4)其他廠商
Zeiss(德國)、Philips(荷蘭)、Visiopharm(丹麥)、Indica Labs(美國)、Ventana醫(yī)療系統(tǒng)公司(美國)也都有比較成熟的全視野數(shù)字切片產(chǎn)品,這里就不一一贅述。
第四節(jié):行業(yè)發(fā)展趨勢
現(xiàn)階段病理診斷已進(jìn)入了數(shù)字化階段,所有病理圖像和管理都可以全部數(shù)字化,實現(xiàn)資源的共享,解放了病理醫(yī)生的部分手腳工作,有效緩解了病理資源分布不均的問題,提高了診斷效率。隨著數(shù)字病理應(yīng)用的普及,其診斷的需求量越來越大。這就要求有更為高效、準(zhǔn)確的診斷方式。一是需要解決數(shù)字切片的標(biāo)準(zhǔn)化,以兼容醫(yī)院醫(yī)學(xué)影像信息系統(tǒng)和其他醫(yī)學(xué)影像數(shù)據(jù),實現(xiàn)廣義上的共享,進(jìn)一步提高互聯(lián)網(wǎng)醫(yī)療的效率;二是采用新技術(shù)實現(xiàn)自動的定量判讀,以解決現(xiàn)有病理醫(yī)生嚴(yán)重不足的問題,以及容易出現(xiàn)漏診,誤診的問題。
1. 數(shù)字切片的標(biāo)準(zhǔn)化
隨著數(shù)字病理診斷的普及,數(shù)字切片掃描儀的廠家越來越多,但數(shù)字切片并沒有統(tǒng)一標(biāo)準(zhǔn),每家都有自己的專有格式,基本互不兼容,例如麥克奧迪實業(yè)集團(tuán)有限公司的MDS格式、Leica 的SVS格式等,并為這些專用文件格式開發(fā)了對應(yīng)的軟件庫和瀏覽器。專用的文件格式只適用于對應(yīng)廠商的產(chǎn)品,不具有通用性。出于技術(shù)保密的考慮,各廠商一般不提供專用文件格式的文檔,即使提供也會省略重要的細(xì)節(jié)。要訪問數(shù)字切片,必須使用廠商提供的軟件庫和瀏覽器,導(dǎo)致醫(yī)生和研究人員受限于特定的廠商。這些問題正影響著數(shù)字病理信息的互聯(lián)互通、遠(yuǎn)程利用與共享,也影響與醫(yī)院醫(yī)學(xué)影像信息系統(tǒng)PACS(Picture Archiving and Communication Systems)、醫(yī)院信息系統(tǒng)HIS (Hospital Information System)HIS的方便整合,在一定程度上制約著數(shù)字病理、遠(yuǎn)程病理的發(fā)展。所以,數(shù)字切片迫切需要一種通用的文件格式或者一種通用的規(guī)范。作為PACS中醫(yī)學(xué)圖像格式和傳輸醫(yī)學(xué)圖像協(xié)議的標(biāo)準(zhǔn)中的DICOM標(biāo)準(zhǔn),專門成立了研究病理問題的DICOM 工作組WG-26,研究解決將DICOM 應(yīng)用于數(shù)字切片的技術(shù)障礙,包括數(shù)字切片的尺寸、數(shù)據(jù)量,數(shù)據(jù)的組織方式和處理方式,并提出了兩個補(bǔ)充協(xié)議122 和145。
2.定量病理
傳統(tǒng)的顯微成像技術(shù)只能提供被觀測標(biāo)本的形態(tài)學(xué)信息和顏色信息,不能進(jìn)一步給出物質(zhì)的組成成分信息,醫(yī)生在診斷時也只能根據(jù)臨床經(jīng)驗提供定性判斷,缺乏定量標(biāo)準(zhǔn),存在一定的誤差,易發(fā)生誤診、漏診。隨著相關(guān)技術(shù)的進(jìn)步,基因組學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)的發(fā)展很大程度上拓展了臨床醫(yī)學(xué)對疾病機(jī)制研究的廣度和深度。組織和細(xì)胞的形態(tài)學(xué)信息已滿足不了診斷需求,需要更關(guān)注細(xì)胞內(nèi)多種蛋白的表達(dá)、分布、調(diào)控、轉(zhuǎn)移及與疾病發(fā)生、發(fā)展的聯(lián)系。尤其是在癌癥的研究領(lǐng)域,揭示腫瘤微環(huán)境在免疫應(yīng)答中的重要作用,探究癌細(xì)胞和基質(zhì)細(xì)胞特別是免疫細(xì)胞的相互關(guān)系,成為精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)攻克癌癥的重要研究議題。顯微光譜成像技術(shù)是在傳統(tǒng)顯微成像技術(shù)的基礎(chǔ)上,結(jié)合目前發(fā)展迅速的光譜成像理論得到的一種新型光學(xué)探測技術(shù)。它是光譜分析技術(shù)和顯微成像技術(shù)的有機(jī)結(jié)合,可以同時提供二維空間信息和一維光譜信息,圖譜合一,配合一定的模式識別算法,能夠?qū)崿F(xiàn)物質(zhì)組成成份定性、定量、定位的綜合指標(biāo)分析,國內(nèi)外的很多研究也表明了此技術(shù)的優(yōu)勢,如Dicker等檢測了皮膚組織中的異常,獲取得到400-800nm之間的連續(xù)波長,利用高光譜成像技術(shù),由此對比了良性痣與黑色素瘤的差異。PerkinElmer近期推出的新一代的組織定量病理學(xué)工作站Mantra,就是采用了多光譜技術(shù),為定量病理的研究工作提供了有力的工具,會促使定量病理的加快臨床應(yīng)用。
3. 人工智能診斷
數(shù)字切片雖然解決了患者和病理醫(yī)生在空間和時間上的障礙,但其診斷還是要依靠病理醫(yī)生。病理診斷是疾病診斷的金標(biāo)準(zhǔn),是精準(zhǔn)醫(yī)療的關(guān)鍵,所以病理醫(yī)生又被稱為“醫(yī)生的醫(yī)生”,但病理醫(yī)生的培養(yǎng)周期很長,一位病理醫(yī)生能夠獨自做病理診斷一般需要先經(jīng)過大學(xué)5年甚至8年的臨床醫(yī)學(xué)教育,再進(jìn)行5年~6年的臨床病理診斷實踐,所以比較緊缺。特別是在中國,據(jù)中國醫(yī)師協(xié)會病理科醫(yī)師分會普查,中國只有 2 萬左右的病理醫(yī)生,如要達(dá)到發(fā)達(dá)國家的要求,有8~10萬的缺口。病理人才奇缺又培養(yǎng)艱難,意味著只有通過創(chuàng)新技術(shù)的手段來解決。近年來人工智能技術(shù)的迅猛發(fā)展,
如谷歌大腦與Verily公司聯(lián)合開發(fā)了一款能用數(shù)字病理切片來診斷乳腺癌的人工智能,并與一位資深病理學(xué)家對130張切片進(jìn)行“讀片”比賽,結(jié)果是人工智能的準(zhǔn)確率超過病理學(xué)家。表明人工智能識別病理切片在技術(shù)上已具備可行性,而且優(yōu)勢非常明顯:具有準(zhǔn)確度高、閱片速度快、成本低、永不疲勞、沒有使用地域限制、重復(fù)性高,更好地輔助病理科醫(yī)生篩查出有問題的病理照片,可以代替病理醫(yī)生80%的工作,使得病理醫(yī)生可以將更多精力放在疑難雜癥的診斷上,有效解決病理醫(yī)生不足和分布不均勻的問題。除此之外也利于病理人才的培養(yǎng),人工智能本身就是一個巨大的數(shù)據(jù)庫,存了大量的病例、圖庫、知識庫。一方面,可以利用這些病例來拓寬病理醫(yī)生的視野;另一方面,在不斷和人工智能接觸的過程中,醫(yī)生也可以不斷學(xué)習(xí)并找到診斷的依據(jù)和思路。人工智能診斷是數(shù)字化病理發(fā)展的必然趨勢。
在技術(shù)、政策、資金等的驅(qū)動下,人工智能診斷將得到迅猛發(fā)展,相信很快就可以商業(yè)化并臨床應(yīng)用,并覆蓋更多的病種。
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