
2020年美國臨床腫瘤學(xué)會(ASCO)摘要投稿結(jié)果揭曉,中國臨床專家和思路迪共同合作的39項科研成果將會亮相此次ASCO年會。今天匯報跨癌種的臨床研究結(jié)果,覆蓋免疫治療、靶向治療和基因變異特征分析等多個領(lǐng)域。從臨床問題出發(fā),為中國腫瘤患者的精準(zhǔn)治療提供更多科學(xué)依據(jù)。
ARID1A基因作為潛在的免疫檢查點抑制劑生物標(biāo)志物的泛癌種分析 (3540)
研究分析了MSKCC的10336例泛癌種測序結(jié)果,和15849例中國泛癌種NGS測序結(jié)果,對比了不同人群不同瘤種中ARID1A基因變異情況、腫瘤突變負荷。中國泛癌種分析結(jié)果顯示,與ARID1A野生型相比,突變型患者具有更高的腫瘤突變負荷;兩組獨立的NSCLC的免疫治療隊列分析結(jié)果均提示,ARID1A突變與免疫治療療效正相關(guān)。
中國實體瘤ALK融合特征(3555)
研究共納入4萬例患者,NGS方法檢測ALK融合形式。其中72例患者中包含了52種不同的ALK融合,其中35種為新的融合形式。在所有ALK融合中,肺癌占最大比例,其次為大腸癌,肝癌,膽道癌,黑色素瘤,癌肉瘤和炎性纖維母細胞瘤等。本次檢測中最常見的ALK融合伴侶為KIF5B,DCTN1和STRN。新的融合形式CLIP4-ALK,EHBP1-ALK和PLB1-ALK均在不同的患者中檢測到兩次。
中國腫瘤患者CDK12突變發(fā)生頻率及CDK12突變與TMB和預(yù)后的相關(guān)性(e13663)
研究共納入15745例中國實體瘤患者,均接受組織NGS檢測,CDK12任何形式突變和有害/疑似有害突變比例分別為3.8%和0.62%,在前列腺癌和乳腺癌中突變比例最高,其它癌種中不到1%。TCGA數(shù)據(jù)顯示CDK12突變在前列腺癌和膽管癌中是不良預(yù)后因子。泛癌種公共隊列數(shù)據(jù)分析顯示CDK12突變患者TMB更高,可能從免疫治療中獲益。
MUC5B在多個瘤種中與更好的預(yù)后相關(guān)(e13515)
研究納入TCGA數(shù)據(jù)庫全瘤種分析(27個瘤種),MUC5B突變與野生型相比,在子宮內(nèi)膜癌、膀胱癌和肺腺癌中跟更長的疾病特異性生存期(DSS),無進展生存期(PFS)和總生存期(OS)有關(guān)。但是在頭頸鱗癌中,MUC5B突變提示更差的PFS和OS。機制分析提示,DNA損傷修復(fù)通路在子宮內(nèi)膜癌、膀胱癌和肺腺癌中進一步富集,但是在頭頸鱗癌中卻沒有。提示DNA損傷修復(fù)增強,可能是MUC5B提示更好預(yù)后的機制之一。
TGF-β通路在腫瘤患者中的變異圖譜及其在免疫調(diào)節(jié)中的作用(e15187)
研究納入三個泛癌種隊列。分析結(jié)果提示TGF-β通路變異與實體瘤的高度微衛(wèi)星不穩(wěn)定性,高水平腫瘤突變負荷,及高水平新生抗原負荷均呈正相關(guān)(p< 0.001)。此外,TGF-β通路變異與不同的免疫相關(guān)基因表達特征相關(guān),進而影響免疫治療療效。
中國人群泛癌種PD-L1表達與TMB分布(e15267)
PD-L1表達與TMB是免疫治療療效最有效的預(yù)測biomarker,本研究分析了上萬例中國人群泛癌種PD-L1表達與TMB分布,并檢測了二者的相關(guān)性。
PD-L1變異和PD-L1表達的關(guān)系:泛癌種分析(e13661)
研究共納入10002例患者,其中1%的患者發(fā)生PD-L1基因變異。PD-L1變異的患者比野生型患者的PD-L1表達更高(P < 0.001)。相比于PD-L1基因點突變(10/24,42%)和PD-L1拷貝數(shù)減少(0/3,0%)的患者,PD-L1陽性表達更常見于PD-L1基因重排(1/1,100%)和PD-L1拷貝數(shù)增加(46/59,78%)的患者。
JAK1/2表達、免疫相關(guān)基因和JAK2基因變異的相關(guān)性:泛癌種分析(e15057)
研究納入10071例患者,相比于JAK1,JAK2表達與46個免疫相關(guān)基因表達的正相關(guān)性更強。363 (3.60%) 的患者發(fā)生JAK2基因變異,JAK2表達在JAK2基因變異的患者和野生型患者中沒有顯著差別。然而,JAK2基因重排 (8/363,2.20%) 和JAK2基因擴增(116/363,31.96%)的患者JAK2表達更高。
中國萬例泛癌種患者FGF/FGFR通路變異圖譜(e13503)
研究共納入12,372例中國實體瘤患者,共覆蓋超過21個瘤種。組織NGS檢測結(jié)果顯示FGF/FGFR通路變異頻率最高的瘤種為食管癌(54.1%),泌尿系統(tǒng)腫瘤(40.7%),及頭頸腫瘤(28.4%)。通路中突變頻率最高的基因為FGFR SNV(5.13%)及FGF擴增(5.08%)。此外,F(xiàn)GF/FGFR通路突變與MSI-H狀態(tài)呈正相關(guān)(p<0.001)。
17993例實體瘤患者的RAS基因突變圖譜(e15615)
研究納入17993例的實體瘤患者(22個瘤種),接受組織NGS檢測,覆蓋單核苷酸突變和拷貝數(shù)變異,致病變異和可能致病變異納入分析?傮wRAS變異的比例為23.09%,KRAS是最常見的變異基因,在胰腺癌中分布最常見(685/842, 81.35%)。KRAS G12C/D/R/V存在于21個癌種中,最常見于結(jié)直腸癌、胰腺癌和肺癌。KRAS G12C,G12D,G12R和G12V的突變頻率分別為9.24%,34.73%,3.54%和21.66%。
IDH突變在實體瘤患者中的分布:一項泛癌種分析(e13638)
研究共納入12,372 例中國實體瘤患者,接受組織NGS檢測。研究發(fā)現(xiàn)IDH突變頻率為0.8%,其中IDH1和IDH2為IDH常見變異基因。所有IDH突變病例中,膽道癌49例(47%),肝癌25例(24%),肺癌16例(15%),結(jié)直腸癌7例(7%)。IDH1 R132C突變占所有IDH突變的45.7%。此外,IDH1/2突變患者中,TP53和ARID1A為高頻突變基因。
中國實體瘤患者融合基因圖譜(e15039)
隨著larotrectinib等以融合基因新生抗原為靶點的靶向藥物獲批,研究融合基因圖譜、及其與靶向治療和免疫治療的關(guān)系,變得尤為重要。該研究回顧性分析了7514例中國實體瘤患者的組織NGS檢測結(jié)果,明確了融合基因在中國實體瘤患者中的檢出率(包括單融合基因、雙融合基因和三融合基因發(fā)生在同一患者的概率)、高發(fā)的基因及其主要伴侶基因。另外,該研究在融合基因與TMB-H、MSI-H的關(guān)系中也有驚人發(fā)現(xiàn)。
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