
臨床基因檢驗已覆蓋了腫瘤、遺傳病、血液病、感染性疾病、神經(jīng)精神性疾病、器官移植、出生缺陷、個體化藥物治療等多個領(lǐng)域,臨床基因檢驗診斷報告對機體易感性評估、疾病診斷、預(yù)后、治療監(jiān)測、遺傳咨詢、健康管理以及家庭生育計劃制定等均具有重要的參考價值。
因此,臨床基因檢驗診斷報告應(yīng)該明確、簡潔、準(zhǔn)確可靠,并具有充分的解釋、可信性和權(quán)威性。中國醫(yī)師協(xié)會檢驗醫(yī)師分會分子診斷專家委員會組織相關(guān)專家對臨床基因檢驗診斷報告模式進(jìn)行了研討并達(dá)成以下共識。
基本要素
1.題目與格式
臨床基因檢驗診斷報告應(yīng)具有醒目的題目,明確標(biāo)示出檢驗的靶標(biāo)。
2.患者信息
報告中明確包含患者姓名、性別、出生日期,必要時注明種族、籍貫或地域來源。當(dāng)家族成員多人同時送檢時,應(yīng)有足夠信息區(qū)分家庭成員身份,需要時包含家族或譜系信息等。對于家系的說明,表格或譜系所提供的信息更適合連鎖分析。
3.臨床信息
臨床醫(yī)師應(yīng)在申請檢驗時提供簡要的臨床信息,應(yīng)至少包含疾病的診斷或初步診斷、申請檢驗?zāi)康?指需要明確疾病發(fā)病狀態(tài)或攜帶者狀態(tài)等)、家族史或既往史。實驗室人員往往需要結(jié)合臨床信息對檢驗結(jié)果進(jìn)行綜合分析,必要時根據(jù)檢驗結(jié)果提出其他的相關(guān)建議。如果未提供任何臨床信息,實驗室人員應(yīng)主動向臨床咨詢[9]。
4.樣本信息
每份樣本應(yīng)當(dāng)有唯一標(biāo)識,注明樣本類型、樣本采集時間、樣本接受時間、報告時間、需要時注明樣本狀態(tài)(如:已分離的DNA或已裂解白細(xì)胞等)。胎兒標(biāo)本(如羊膜穿刺標(biāo)本、絨毛膜標(biāo)本等)應(yīng)與其母親標(biāo)本清晰分開,且不可以使用母親姓名。
5.醫(yī)師和實驗室信息
包括申請醫(yī)師的姓名、實驗室名稱、實驗室地址和聯(lián)系電話。
6.頁碼
報告單中每頁均應(yīng)包含頁碼,頁碼采用'當(dāng)前頁碼/總頁碼'的格式注明,即使報告單僅有1頁,也應(yīng)當(dāng)采用此種方式進(jìn)行標(biāo)注。報告為多頁時,每頁均應(yīng)注明患者基本信息和樣本唯一標(biāo)識(如ID號)[10]。
特定要素
1.注明方法學(xué)
報告中應(yīng)簡單注明所采用的方法學(xué)[11],尤其是針對某一檢驗項目具有多種檢驗方法時。這對分子檢驗項目非常重要,因為該患者的家屬可能在其他實驗室進(jìn)行了檢驗,或者該患者(尤其是陰性結(jié)果)會在今后進(jìn)行隨訪檢驗。
2.注明檢驗程度的詳細(xì)信息
應(yīng)明確說明所檢驗的基因座位或突變位點,這一點在報告陰性結(jié)果時至關(guān)重要。
3.分子遺傳檢驗項目
應(yīng)提供基因參考序列。
4.質(zhì)量控制信息
需要時應(yīng)注明,如涉及腫瘤病理標(biāo)本應(yīng)說明腫瘤細(xì)胞的百分比等信息。
結(jié)果報告
1.結(jié)果報告方式
臨床基因檢驗診斷報告應(yīng)采用簡潔清晰的報告方式,包含所采用的分析過程及對實驗結(jié)果的解釋,使得檢驗結(jié)果和所包含的信息能有效地傳達(dá)給臨床醫(yī)師。應(yīng)準(zhǔn)確客觀地描述所檢驗的結(jié)果,避免引起歧義[13,14]。定性試驗不應(yīng)簡單地報告為'陰性'、'陽性'或'不確定',結(jié)果報告中應(yīng)至少包括檢驗?zāi)繕?biāo),如:'HCV RNA檢驗'、'沙眼衣原體DNA檢驗',陰性結(jié)果應(yīng)描述為'未檢出'、'低于檢驗下限'或'未檢驗到突變'。定量試驗的檢驗結(jié)果需提供具體測定數(shù)值及參考范圍;蛐突蚧蜃儺惖臋z驗結(jié)果需明確描述所檢驗的基因位點或變異位點。必要時,在報告解釋中進(jìn)行詳細(xì)說明。
2.術(shù)語規(guī)范描述
檢驗結(jié)果中的術(shù)語應(yīng)使用國際權(quán)威組織或數(shù)據(jù)庫發(fā)布的最新標(biāo)準(zhǔn)命名,并在報告解釋中注明出處。當(dāng)某個非正式命名被廣泛使用時,也可包含此名稱,可以用括號將非正式命名放于標(biāo)準(zhǔn)命名的后面;或者將通用的非正式命名放在結(jié)果部分,而將標(biāo)準(zhǔn)命名放在報告解釋的方法學(xué)部分;或者在報告解釋中單獨加以說明。對于分子遺傳檢驗,參考序列和命名應(yīng)當(dāng)使用當(dāng)前的人類基因組變異協(xié)會(HGVS)的標(biāo)準(zhǔn)命名;對于細(xì)胞遺傳和微陣列芯片,應(yīng)當(dāng)采用最新版本的人類細(xì)胞遺傳學(xué)國際命名體制(ISCN)的標(biāo)準(zhǔn)命名[2]。
3.注明所采用的數(shù)據(jù)庫
需要注意不同的數(shù)據(jù)庫版本中,基因堿基號碼或者密碼子的號碼可能不同,此時應(yīng)根據(jù)最新的數(shù)據(jù)庫進(jìn)行標(biāo)注[15,16,17,18]。
4.結(jié)果報告內(nèi)容
不應(yīng)使用含義模糊的詞匯,不可使用'+'或'-'符號,因為陰性結(jié)果容易被非專業(yè)人士誤解為'已排除'。如:對于初診白血病患者微小殘留監(jiān)測分子標(biāo)志物篩查,如未檢出融合基因和抗原受體基因單克隆重排,應(yīng)描述為'未篩查到合適的微小殘留監(jiān)測分子標(biāo)志物'。如篩查到合適的微小殘留監(jiān)測指標(biāo),應(yīng)描述為'篩查到xx融合基因和xx抗原受體基因重排(如TCR基因Vδ2-Dδ3重排),可作為微小殘留監(jiān)測的分子標(biāo)志物',基因重排分子標(biāo)志物應(yīng)進(jìn)一步注明個體特異性的結(jié)合部序列,以供患者轉(zhuǎn)至其他醫(yī)療機構(gòu)治療和監(jiān)測時參考。對于誘導(dǎo)緩解治療后及持續(xù)治療中的白血病患者進(jìn)行微小殘留監(jiān)測時,監(jiān)測結(jié)果以百分比(白血病細(xì)胞占單個核細(xì)胞的比例)形式報告監(jiān)測結(jié)果。
5.多項檢驗結(jié)果報告
多種可能的病理性變異被檢出時,應(yīng)對該變異進(jìn)行說明。多項檢驗的結(jié)果應(yīng)該分開報告。
6.藥物治療相關(guān)的報告
應(yīng)結(jié)合患者的臨床資料以及比較全面的藥物相關(guān)基因信息等給予用藥的建議。
7.檢驗結(jié)果與其他結(jié)果不符時的報告要求:
檢驗結(jié)果與其他實驗結(jié)果或臨床資料不符時,應(yīng)進(jìn)行調(diào)查并將資料備案,必要時進(jìn)行驗證。
8.結(jié)果錄入要求
為避免錯誤,不支持手寫報告,應(yīng)使用計算機錄入結(jié)果。
9.報告中實驗室自建方法信息
采用實驗室自建方法時應(yīng)注明 '該實驗性能特性由xx實驗室確認(rèn),未經(jīng)過國家食品藥品監(jiān)督管理總局的批準(zhǔn)' [19]。
報告解釋
1.連鎖分析
進(jìn)行連鎖分析時,分子遺傳疾病的檢驗報告應(yīng)包含對假陰性和假陽性的評價和原因分析。
2.復(fù)雜遺傳疾病的基因檢驗
涉及多種突變的檢驗報告,應(yīng)說明突變檢出率以及某些突變未包含在檢驗范圍內(nèi)可能導(dǎo)致的潛在風(fēng)險。如:家族性乳腺癌的致病基因變異在分子水平上具有很強的異質(zhì)性,可能在不同患者或家族中存在多種突變,常規(guī)分子檢驗技術(shù)很難達(dá)到100%的檢出率。
3.陰性結(jié)果
陰性并不能完全排除患者存在基因突變。檢驗報告應(yīng)當(dāng)采用醫(yī)師可以理解的方式對此進(jìn)行說明,推薦說明基于該種族的已知人群等位基因頻率所得的殘余風(fēng)險值。
4.陽性結(jié)果
由于某些遺傳疾病的基因型和表型間的關(guān)系較復(fù)雜,某種突變位點陽性的報告,可能不能提供該結(jié)果所產(chǎn)生臨床影響的信息,而臨床需要根據(jù)這些結(jié)果做出是否干預(yù)決定。因此,對于這種檢驗,報告中應(yīng)該包含針對實驗結(jié)果局限性的討論,以及所檢出的結(jié)果的臨床意義,如顯性或隱性遺傳的情況、復(fù)發(fā)的風(fēng)險、外顯率、嚴(yán)重性和其他基因型和表型間的相關(guān)性。對報告的解釋至少要包含相關(guān)信息,使醫(yī)師能夠利用現(xiàn)有的文獻(xiàn)資源來進(jìn)行臨床判斷。實驗室應(yīng)說明目前的解釋只是基于現(xiàn)有的知識,將來可能隨著研究的發(fā)展會有所變化。
5.咨詢建議
適用時報告應(yīng)包含患者進(jìn)行咨詢的建議,由專業(yè)人士為其解釋檢驗結(jié)果的影響、潛在風(fēng)險和不確定性,由此衍生的對生育或者其他醫(yī)學(xué)干預(yù)措施的選擇。這主要是因為某些分子基因檢驗結(jié)果較為復(fù)雜,有些結(jié)果可能僅僅與疾病發(fā)病風(fēng)險有關(guān),而不具有明確的診斷依據(jù)。
6.結(jié)果整合分析
如果同一份標(biāo)本進(jìn)行了多個項目檢驗,報告解釋時應(yīng)對結(jié)果進(jìn)行整合分析,為臨床提供清晰和簡明的解釋。
備注說明
備注中應(yīng)說明檢驗方法的局限性、檢驗靈敏度和特異性[22]。如測序方法并不能檢驗到大的基因缺失和重復(fù)等。如果標(biāo)本的某些特征會影響檢驗結(jié)果的質(zhì)量,應(yīng)予以說明。例如,腫瘤組織基因突變的檢驗受到腫瘤細(xì)胞與正常細(xì)胞比例的影響,或組織活檢的結(jié)果受到取材部位的影響等。如果分析前的樣本質(zhì)量不能受到實驗室的保證和確認(rèn),報告單中應(yīng)說明該實驗結(jié)果僅針對所接收到的樣本。如果部分檢驗在其他實驗室進(jìn)行,報告單中應(yīng)明確說明哪些結(jié)果出自哪些實驗室,例如本實驗室經(jīng)過相關(guān)認(rèn)證/認(rèn)可,參與檢驗的其他實驗室未經(jīng)認(rèn)證/認(rèn)可,這一點也需要說明。建議參與檢驗的其他實驗室提供原始報告。個別檢驗項目的報告單中可能包含多人結(jié)果,如同一家庭的多個成員,此時需注明成員之間的血緣或譜系。建議每個個體分開檢驗,以保證檢驗結(jié)果的機密性。應(yīng)注明報告結(jié)果的咨詢方式。
報告審核
最終報告應(yīng)由具備資質(zhì)的醫(yī)師或者授權(quán)簽字人審核后簽發(fā)(如:產(chǎn)前篩查報告須經(jīng)具備產(chǎn)前診斷臨床資質(zhì)的副高級職稱以上醫(yī)務(wù)人員審核簽發(fā))。如果采用電子簽名,簽字人的原始簽字可以不出現(xiàn)在報告中,但實驗室必須有適當(dāng)?shù)墓芾項l例和程序來確保報告在發(fā)送前已被審核和認(rèn)可[23]。
報告單保存
腫瘤相關(guān)的基因檢驗報告應(yīng)按相關(guān)規(guī)定時限保存。遺傳學(xué)相關(guān)的基因檢驗結(jié)果對其親屬也有重要參考價值,建議診斷報告應(yīng)至少保存20年。報告可以采用電子版格式進(jìn)行保存。
項目主持者:張曼,中國醫(yī)師協(xié)會檢驗醫(yī)師分會會長
分項目主持者:王華梁,中國醫(yī)師協(xié)會檢驗醫(yī)師分會分子診斷專家委員會主任委員
執(zhí)筆者(按姓氏漢語拼音排列):崔巍、肖艷群、楊卓
本共識由中國醫(yī)師協(xié)會檢驗醫(yī)師分會全體委員審閱。
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