
如今,腫瘤基因高通量測(cè)序技術(shù)在腫瘤靶向藥物選擇、耐藥檢測(cè)及微小病灶殘留監(jiān)測(cè)等方面,發(fā)揮著越來越顯著的作用。對(duì)于非小細(xì)胞肺癌患者而言,EGFR/KRAS/BRAF突變以及ALK融合的檢測(cè)具有重要的臨床意義。
在本屆ASCO年會(huì)上,上海交通大學(xué)附屬胸科醫(yī)院婁加陶教授等研究者的一項(xiàng)相關(guān)研究被收錄。該研究運(yùn)用基于擴(kuò)增子方法進(jìn)行的二代測(cè)序技術(shù)——Firefly?技術(shù)檢測(cè)非小細(xì)胞肺癌患者EGFR/KRAS/BRAF突變以及ALK融合情況。
研究概況
該研究采用安可濟(jì)集團(tuán)自主研發(fā)的擴(kuò)增子方法檢測(cè)EGFR/BRAF/KRAS基因突變?cè)噭┖,以及ALK基因融合試劑盒。運(yùn)用Firefly?和ddPCR兩種技術(shù)對(duì)64名晚期肺癌患者的EGFR/BRAF/KRAS和ALK基因進(jìn)行檢測(cè),根據(jù)檢測(cè)結(jié)果對(duì)兩種技術(shù)進(jìn)行對(duì)比。
在突變頻率為0.1%,DNA投入量為20ng的情況下,EGFR/BRAF/KRAS - 3基因試劑盒的分析靈敏度為100%。同樣,當(dāng)DNA投入量相同時(shí),ALK融合檢測(cè)試劑盒在突變頻率為0.1%的情況下,分析靈敏度為75%,在突變頻率為0.25%的情況下,分析靈敏度為100%。在此次研究中,對(duì)受檢患者EGFR的5種突變類型:19Del, T790M, L858R, G719X, L861X,以及KRAS的2種突變類型(G12X)都進(jìn)行了檢測(cè)。Firefly?和ddPCR的檢測(cè)結(jié)果一致率達(dá)到了99%,其中陽(yáng)性預(yù)測(cè)值(PPV, Positive Predictive Value)為100%,陰性預(yù)測(cè)值(NPV, Negative Predictive Value)為98.7%。統(tǒng)計(jì)分析顯示Firefly?和ddPCR之間等位基因頻率的相關(guān)系數(shù)r2為0.9。
安可濟(jì)集團(tuán)獨(dú)創(chuàng)的Firefly? ctDNA-NGS技術(shù),能夠利用基于串聯(lián)糾錯(cuò)的誤差糾正機(jī)制快速檢測(cè)包括單核苷酸突變以及基因融合在內(nèi)的低頻突變;同時(shí)具有極高的靈敏度與特異性,臨床可操作性亦極強(qiáng)。未來,隨著這一技術(shù)的進(jìn)一步推廣,將更好地支持靶向治療選擇、耐藥檢測(cè)和治療監(jiān)測(cè)。

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