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美國(guó)分子病理學(xué)學(xué)會(huì)（AMP）和美國(guó)病理學(xué)會(huì)（CAP）近日公布了基于二代測(cè)序的腫瘤panels驗(yàn)證指南，以提高實(shí)驗(yàn)室測(cè)序結(jié)果的質(zhì)量，為患者提供更好的臨床醫(yī)療服務(wù)。具體指南發(fā)表于《The Journal of Molecular Diagnostics》雜志上，包括了靶向測(cè)序方法和數(shù)據(jù)分析的概述、新檢測(cè)方法的注意事項(xiàng)以及試驗(yàn)驗(yàn)證和質(zhì)量控制指標(biāo)的實(shí)施建議。

指南制定組主席，芝加哥Ann and Robert H. Lurie兒童醫(yī)院的病理學(xué)家Lawrence Jennings在一份聲明中表示，在精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)時(shí)代，NGS已經(jīng)迅速成為檢測(cè)多種體細(xì)胞變異、診斷疾病以及預(yù)測(cè)療效的手段之一，然而分析驗(yàn)證過(guò)程仍然具有挑戰(zhàn)性。

美國(guó)分子病理學(xué)學(xué)會(huì)召集了包括來(lái)自美國(guó)病理學(xué)會(huì)的多學(xué)科專家，共同總結(jié)了當(dāng)前知識(shí)、揭露存在的挑戰(zhàn)，并提供指導(dǎo)以最好的驗(yàn)證檢測(cè)，最終改善患者的護(hù)理。

該指南特別強(qiáng)調(diào)了分子實(shí)驗(yàn)室對(duì)建立最佳NGS檢測(cè)方法的重要性，并指出隨著技術(shù)的前進(jìn)，未來(lái)指南會(huì)不斷更新。

該指南強(qiáng)調(diào)了NGS檢測(cè)的開(kāi)發(fā)、優(yōu)化和驗(yàn)證，包括panel內(nèi)容的選擇建議、驗(yàn)證前進(jìn)行優(yōu)化；使用參考細(xì)胞系和參考物質(zhì)來(lái)評(píng)估檢測(cè)性能；確定每種突變類型的陽(yáng)性百分比和陽(yáng)性預(yù)測(cè)值；明確最低覆蓋深度以及最小樣本量。

指南還指出，在積累驗(yàn)證數(shù)據(jù)之前建立試驗(yàn)驗(yàn)證協(xié)議非常重要，并且應(yīng)該使用所分析的樣本類型進(jìn)行驗(yàn)證。指南還提醒：檢測(cè)性能會(huì)根據(jù)被檢測(cè)的基因組區(qū)域而異，而且盡管使用最好的儀器或最專業(yè)的人員，檢測(cè)結(jié)果還是會(huì)出現(xiàn)差異。

此外，作者還寫道，實(shí)驗(yàn)室檢測(cè)的定量分析性能（例如NGS檢測(cè)），并不一定達(dá)到臨床水平的預(yù)測(cè)性能。疾病的內(nèi)在生物變異對(duì)臨床敏感性以及NGS檢測(cè)的特異性影響最大。專家小組建議在試驗(yàn)設(shè)計(jì)時(shí)就明確臨床有效性和臨床實(shí)用性。

NGS在檢測(cè)多種體細(xì)胞變異上具有很大的優(yōu)勢(shì)，但在使用過(guò)程中還存在著挑戰(zhàn)，并且需要分析驗(yàn)證來(lái)保證高質(zhì)量結(jié)果。