
近日,賽默飛與美國(guó)疾病預(yù)防控制中心(CDC)特殊細(xì)菌學(xué)參考實(shí)驗(yàn)室合作,研發(fā)出一種先進(jìn)的軟件解決方案,通過(guò)該軟件解決方案,研究人員不需要引用多個(gè)數(shù)據(jù)庫(kù),而是通過(guò)一個(gè)領(lǐng)域?qū)<揖湍軌蚋斓淖R(shí)別微生物病原體在全球爆發(fā)的潛在根源。
賽默飛設(shè)計(jì)的MicrobeBridge軟件平臺(tái)可以無(wú)縫連接到Sanger測(cè)序結(jié)果的MicrobeNet數(shù)據(jù)庫(kù)。目前,分析測(cè)序數(shù)據(jù)分散在多個(gè)軟件包中。MicrobeBridge軟件平臺(tái)使研究人員能夠更容易地訪問(wèn)存儲(chǔ)在MicrobeNet中的公共衛(wèi)生信息,并提供基礎(chǔ)實(shí)驗(yàn)室監(jiān)測(cè)和疾病暴發(fā)的整體理解。
"以DNA為基礎(chǔ)的微生物鑒定技術(shù)已經(jīng)成為公共健康科學(xué)家們識(shí)別和追蹤傳染病疫情的一個(gè)有效工具," 賽默飛公共衛(wèi)生部主任Dan Didier說(shuō)。"然而數(shù)據(jù)分析降低了公共衛(wèi)生實(shí)驗(yàn)室迅速采取行動(dòng)的能力。MicrobeBridge軟件平臺(tái)克服了研究人員裝備技術(shù)上的障礙,幫助研究人員更快地應(yīng)對(duì)威脅人類健康的病原體。"
MicrobeBridge集成所有應(yīng)用生物系統(tǒng)毛細(xì)管電泳儀器和原始Sanger測(cè)序數(shù)據(jù)的自動(dòng)化組裝和質(zhì)量控制到一個(gè)可搜索的格式化MicrobeNet數(shù)據(jù)庫(kù)中,從而最大限度的減少匹配和識(shí)別標(biāo)本所需的工作量。賽默飛還計(jì)劃為下一代測(cè)序和質(zhì)譜平臺(tái)開發(fā)兼容軟件。
"對(duì)我們特別采集的高度優(yōu)化病原體數(shù)據(jù)庫(kù)來(lái)講,擴(kuò)大MicrobeNet將允許公共衛(wèi)生實(shí)驗(yàn)室在世界任何地方得到序列、表型或其他最終的測(cè)試和匹配結(jié)果," CDC特殊細(xì)菌學(xué)參考實(shí)驗(yàn)室,細(xì)菌特殊病原體分部,高病原和病理結(jié)果控制中心主管John R. McQuisto博士說(shuō)。通過(guò)添加MicrobeBridge,研究人員和公共衛(wèi)生實(shí)驗(yàn)室現(xiàn)在能夠輕松地獲得由疾病預(yù)防控制中心病原體專家提供的成千上萬(wàn)的生物信息"。
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