
近日,國(guó)家兒童醫(yī)學(xué)中心、上海交通大學(xué)醫(yī)學(xué)院附屬上海兒童醫(yī)學(xué)中心遺傳分子診斷科團(tuán)隊(duì),在國(guó)際醫(yī)學(xué)檢驗(yàn)領(lǐng)域權(quán)威期刊《Clinical Chemistry》上發(fā)表題為《Integrated Genotyping Strategies for Uncovering Detailed Haplotype Structures and Characterization of DMD Duplications》的研究論文。該研究首次在單倍型層面系統(tǒng)解析了DMD基因重復(fù)變異的復(fù)雜結(jié)構(gòu)特征,為杜氏/貝氏肌營(yíng)養(yǎng)不良(DMD/BMD)的精準(zhǔn)診斷與遺傳咨詢提供了新思路。
杜氏/貝氏肌營(yíng)養(yǎng)不良(DMD/BMD)是一種常見的X連鎖遺傳性肌病,主要由DMD基因的缺失或重復(fù)引起。相較于缺失變異,DMD基因重復(fù)變異的結(jié)構(gòu)更為復(fù)雜,僅判斷“是否重復(fù)”難以準(zhǔn)確評(píng)估其致病性及表型嚴(yán)重程度。因此,深入解析重復(fù)變異的具體構(gòu)型與插入位置,對(duì)實(shí)現(xiàn)精準(zhǔn)診療至關(guān)重要。
研究設(shè)計(jì)
上海兒童醫(yī)學(xué)中心遺傳分子診斷科團(tuán)隊(duì)通過(guò)對(duì)既往診斷病例的系統(tǒng)回顧,構(gòu)建了DMD基因重復(fù)變異攜帶者隊(duì)列,并綜合運(yùn)用全基因組測(cè)序(WGS)與光學(xué)基因圖譜(OGM)技術(shù),系統(tǒng)重建了DMD重復(fù)變異的單倍型結(jié)構(gòu),進(jìn)一步評(píng)估了其對(duì)基因產(chǎn)物的影響,提升了基因型與表型關(guān)聯(lián)預(yù)測(cè)的準(zhǔn)確性。
研究結(jié)果顯示,約58%(22/38)的DMD重復(fù)變異為串聯(lián)重復(fù)排列模式,其余42%(16/38)呈現(xiàn)復(fù)雜構(gòu)型,其形成與高同源性重復(fù)元件密切相關(guān)。值得注意的是,34%(13/38)的病例僅憑WGS難以明確致病性,而33%(2/6)的病例在OGM技術(shù)下未能完全解析其單倍型結(jié)構(gòu)。研究強(qiáng)調(diào),整合WGS與OGM的聯(lián)合診斷策略,可有效實(shí)現(xiàn)重復(fù)單倍型的精確重建,顯著提升臨床診斷的準(zhǔn)確性與可靠性。
臨床意義不明DMD基因重復(fù)變異的臨床診斷流程圖
該研究首次系統(tǒng)描繪了DMD基因重復(fù)變異的分子圖譜,揭示了其廣泛的結(jié)構(gòu)復(fù)雜性,凸顯了多技術(shù)整合在解析臨床意義不明重復(fù)變異方面的重要價(jià)值。
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