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近日，香港科技園創(chuàng)新診斷科技中心盧煜明（Dennis Lo）教授領(lǐng)導(dǎo)的研究團(tuán)隊(duì)發(fā)現(xiàn)，通過測定循環(huán)EBV DNA片段的數(shù)量及其大小、基序和甲基化特征，可以獲得更多線索來預(yù)測鼻咽癌的風(fēng)險(xiǎn)。

循環(huán)腫瘤DNA（ctDNA）的分析正逐漸成為癌癥診斷中的有效工具。鼻咽癌（NPC）主要發(fā)生在華南地區(qū)，與EB病毒密切相關(guān)。血漿中癌癥來源的EBV DNA是一種有用的腫瘤標(biāo)志物，可用于癌癥檢測、預(yù)后和監(jiān)測。

近日，香港科技園創(chuàng)新診斷科技中心盧煜明（Dennis Lo）教授領(lǐng)導(dǎo)的研究團(tuán)隊(duì)發(fā)現(xiàn)，通過測定循環(huán)EBV DNA片段的數(shù)量及其大小、基序和甲基化特征，可以獲得更多線索來預(yù)測鼻咽癌的風(fēng)險(xiǎn)。這項(xiàng)研究成果于3月6日發(fā)表在《Cancer Cell》雜志上。

“與鼻咽癌相關(guān)的片段組學(xué)特征的發(fā)現(xiàn)增強(qiáng)了血漿EBV DNA在鼻咽癌風(fēng)險(xiǎn)預(yù)測方面的性能，”盧教授談道。他是這篇論文的通訊作者。

為了對這種基于片段組學(xué)（fragmentomics）的預(yù)測方法進(jìn)行前瞻性研究，盧教授及其同事首先采用實(shí)時(shí)定量PCR分析，在2萬多名無癥狀的男性參與者的血漿樣本中尋找游離EBV DNA的存在。這些參與者的年齡介于40歲至62歲。

在此基礎(chǔ)上，研究團(tuán)隊(duì)分別采用靶向EBV測序和基于片段組學(xué)的甲基化分析（FRAGMA），對309名個(gè)體血液樣本中的EBV DNA片段特征和甲基化圖譜進(jìn)行分析。這些人在首次PCR篩查后的一個(gè)月內(nèi)接受了第二輪PCR檢測，結(jié)果仍然顯示為陽性。

他們的研究結(jié)果表明，在最終患上鼻咽癌的個(gè)體中，血液樣本中檢測到的EBV DNA中的CC末端基序水平往往低于正常水平。此外，血液中的EBV DNA水平、片段大小和甲基化模式也會影響鼻咽癌風(fēng)險(xiǎn)。

“與PCR檢測呈陰性的受試者相比，帶有異常片段組學(xué)特征和較高EBV DNA數(shù)量的受試者患上鼻咽癌的風(fēng)險(xiǎn)增加了87.1倍，”作者報(bào)告說。他們認(rèn)為，這些結(jié)果表明血漿DNA片段組學(xué)可以預(yù)測未來的癌癥風(fēng)險(xiǎn)。

例如，在兩次EBV DNA PCR篩查呈陽性的309名個(gè)體中，研究人員發(fā)現(xiàn)了34例鼻咽癌病例。當(dāng)他們采用靶向測序技術(shù)對“持續(xù)陽性的”237名個(gè)體的血液樣本進(jìn)行分析時(shí)，又發(fā)現(xiàn)了4例鼻咽癌病例。

同樣，根據(jù)EBV DNA片段特征，他們在其中一次PCR檢測呈陽性的677名個(gè)體中篩查出3例鼻咽癌病例。研究人員利用靶向測序技術(shù)對近17,000名第一輪PCR檢測呈陰性的個(gè)體進(jìn)行分析后，又發(fā)現(xiàn)了17例鼻咽癌病例。

作者承認(rèn)，與基于PCR的循環(huán)EBV DNA篩查相比，靶向新一代測序的成本更高。另一方面，他們認(rèn)為“特異性的增強(qiáng)將大大減少需要通過內(nèi)窺鏡檢查和磁共振檢查來確診或排除的病例數(shù)量”。

“我們目前的研究結(jié)果表明，基于NGS的血漿EBV DNA分子圖譜可以為鼻咽癌篩查提供額外的臨床信息，”他們談道�！斑@些分子分析能夠?qū)�篩查對象進(jìn)行更好的風(fēng)險(xiǎn)分層�！�

參考文獻(xiàn)

Fragmentomics profiling and quantification of plasma Epstein-Barr virus DNA enhance prediction of future nasopharyngeal carcinoma