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國科金發(fā)計〔2024〕125號
國家自然科學(xué)基金委員會現(xiàn)發(fā)布免疫力數(shù)字解碼重大研究計劃2024年度項目指南，請申請人及依托單位按項目指南所述的要求和注意事項申請。
國家自然科學(xué)基金委員會
2024年4月12日
免疫力數(shù)字解碼重大研究計劃2024年度項目指南
免疫力是人體抵御病原入侵，清除抗原性異物，監(jiān)控及維系機(jī)體健康穩(wěn)態(tài)的綜合能力。免疫系統(tǒng)巨大多樣性和復(fù)雜性是免疫力的關(guān)鍵基礎(chǔ)，而傳統(tǒng)研究模式未能系統(tǒng)揭示免疫力生成和演變規(guī)律。本重大研究計劃鼓勵科學(xué)問題驅(qū)動與數(shù)據(jù)驅(qū)動相結(jié)合的科研范式變革，資助可產(chǎn)生質(zhì)量高、擴(kuò)展性強(qiáng)、集成性好的免疫力數(shù)據(jù)的項目，建立統(tǒng)一的數(shù)據(jù)匯交管理機(jī)制和平臺，標(biāo)準(zhǔn)化獲取人體免疫力大數(shù)據(jù)。通過免疫力大數(shù)據(jù)的數(shù)字呈現(xiàn)與深度解碼，全景式認(rèn)知健康及疾病狀況下人體免疫系統(tǒng)的運行機(jī)制，多角度闡明免疫力的科學(xué)內(nèi)涵，促進(jìn)精準(zhǔn)診療，服務(wù)于“健康中國”戰(zhàn)略。
一、科學(xué)目標(biāo)
基于高質(zhì)量、標(biāo)準(zhǔn)化的免疫力大數(shù)據(jù)，開展人體免疫力整體性和系統(tǒng)性數(shù)字化解析與重構(gòu)研究，揭示免疫力構(gòu)成的生物基礎(chǔ)、免疫力維持的關(guān)鍵特征和免疫力調(diào)控的普適規(guī)律，進(jìn)而闡明免疫力的科學(xué)內(nèi)涵；對免疫力進(jìn)行定量化表征和數(shù)字化呈現(xiàn)，建立人群免疫力特征圖譜，分析免疫力與衰老、疾病等重大生命健康事件的關(guān)系并闡釋其內(nèi)在機(jī)制和規(guī)律；開發(fā)基于免疫力數(shù)據(jù)的疾病風(fēng)險預(yù)警、免疫力可視化和免疫力年齡測定等關(guān)鍵技術(shù)，建立個體和群體的免疫力檔案，開展基于免疫力干預(yù)的健康維護(hù)及疾病防治新策略，形成未病先防、疾病早診、預(yù)后評估、個性化醫(yī)療和健康管理新模式。
二、核心科學(xué)問題
�。ㄒ唬┟庖吡�(fù)雜系統(tǒng)的物質(zhì)基礎(chǔ)和動態(tài)規(guī)律。
針對免疫力復(fù)雜系統(tǒng)的高度多樣性、時空動態(tài)性、多維交互性、自主適應(yīng)性和模式記憶性等特點，采用動態(tài)化、跨尺度、多層次的全景研究新范式，以模型驅(qū)動和數(shù)據(jù)驅(qū)動相結(jié)合的研究方法，明確免疫力復(fù)雜系統(tǒng)的時空動態(tài)特征，闡明免疫力的組成要素、內(nèi)在聯(lián)系與變化規(guī)律等生物學(xué)內(nèi)涵，揭示免疫力本質(zhì)規(guī)律和深層運行機(jī)制。
�。ǘ┒嗄B(tài)免疫力定量表征及數(shù)字呈現(xiàn)。
建立不同免疫力表征狀態(tài)的人群隊列，獲取并分析免疫分子和細(xì)胞的多樣性信息，系統(tǒng)解析在分子、細(xì)胞、細(xì)胞間關(guān)聯(lián)、器官、人群等不同尺度的免疫力數(shù)據(jù)，形成標(biāo)準(zhǔn)化的多維免疫大數(shù)據(jù)群，對多源、高維、跨尺度的免疫力數(shù)據(jù)進(jìn)行耦合、重構(gòu)與全景化表征，實現(xiàn)免疫力數(shù)字化呈現(xiàn)和量化評估，精準(zhǔn)刻畫免疫力肖像。
�。ㄈ┗诿庖吡獯a的疾病診療與健康評估。
闡明重大生命健康事件的免疫力特征及其演變規(guī)律，獲取重大疾病在器質(zhì)性病變前的免疫力信號，設(shè)立基于免疫力解碼的疾病分子分型、精準(zhǔn)診療與預(yù)后評估標(biāo)準(zhǔn)，并整合傳統(tǒng)醫(yī)學(xué)證候辨識和“治未病”等理念與方法，構(gòu)建疾病預(yù)警系統(tǒng)，及時評估健康狀態(tài)并發(fā)現(xiàn)疾病早期隱患，為關(guān)鍵生命過程的免疫力干預(yù)提供理論依據(jù)。
三、2024年度資助研究方向
本重大研究計劃擬聚焦我國高發(fā)病/高死亡率惡性腫瘤、自身免疫性疾病等重大疾病，優(yōu)先資助本計劃尚未立項的疾病類型，針對不同免疫狀態(tài)，以獲取高質(zhì)量、多維度、時空動態(tài)的人體免疫力大數(shù)據(jù)為前提，鼓勵依托具有完善基礎(chǔ)數(shù)據(jù)和隨訪方案的隊列資源，建立關(guān)鍵技術(shù)群，旨在闡明免疫復(fù)雜系統(tǒng)動態(tài)協(xié)同模式和時空交互規(guī)律。本計劃擬設(shè)置培育項目、重點支持項目及集成項目：
�。ㄒ唬┡嘤椖俊�
圍繞上述科學(xué)問題，以總體科學(xué)目標(biāo)為牽引，立足研究范式創(chuàng)新，對于探索性強(qiáng)、選題新穎、前期研究基礎(chǔ)較好的申請項目，將以培育項目的方式予以資助，具體研究方向如下：
1. 健康狀態(tài)免疫力特征與變化規(guī)律。
圍繞不同年齡階段（如嬰幼兒、青春期、成年、老年等），不同健康狀態(tài)（如長壽、中醫(yī)偏頗體質(zhì)等），不同遺傳背景或特殊生活環(huán)境的人群，鼓勵采用高通量多組學(xué)技術(shù)，采集生理狀態(tài)下免疫細(xì)胞發(fā)育與新型細(xì)胞亞群、免疫識別與活化、免疫記憶與耗竭、免疫代謝與表觀遺傳等免疫力數(shù)據(jù)，豐富免疫系統(tǒng)可測量參數(shù)，延展免疫力大數(shù)據(jù)的覆蓋維度，解碼免疫行為并揭示深層規(guī)律，建立健康個體的免疫力檔案。從免疫力維度表征機(jī)體的健康狀態(tài)，實現(xiàn)人體免疫年齡及健康狀態(tài)的數(shù)字判讀。
2. 重大疾病狀態(tài)免疫力動態(tài)感知機(jī)制。
針對我國高發(fā)病/高死亡率惡性腫瘤和自身免疫病等重大疾病，從分子、細(xì)胞、組織、器官、證候等不同尺度，分析疾病發(fā)生發(fā)展等關(guān)鍵環(huán)節(jié)的免疫特征信息，如免疫微環(huán)境、免疫調(diào)節(jié)與耐受、移植免疫排斥、免疫細(xì)胞及其亞群、腫瘤新抗原等，揭示免疫力時空變化與疾病演進(jìn)過程之間的相關(guān)性和因果性，建立微觀免疫力數(shù)值與宏觀疾病表征之間的定量映射關(guān)系，闡明免疫力在重大疾病時空演變過程中的動態(tài)規(guī)律和機(jī)制。
3. 人工智能賦能的免疫力量化表征及數(shù)字化呈現(xiàn)。
建立從免疫細(xì)胞群和免疫分子等免疫載體數(shù)據(jù)中捕獲用于量化免疫特征信息的新方法，發(fā)展諸如可解釋機(jī)器學(xué)習(xí)等先進(jìn)人工智能技術(shù)，對多源、高維、跨尺度的免疫力數(shù)據(jù)進(jìn)行耦合重構(gòu)，開發(fā)前沿計算模型和大數(shù)據(jù)解析算法，提取可以表征免疫力的多維信息，實現(xiàn)免疫力的數(shù)字化與全景化呈現(xiàn)。
4. 免疫復(fù)雜系統(tǒng)的時空動態(tài)特征。
針對代表性疾病或免疫過程，基于復(fù)雜系統(tǒng)的視角，研究免疫力組成元件、關(guān)系集合、系統(tǒng)結(jié)構(gòu)等關(guān)鍵要素，融合還原論、控制論、系統(tǒng)論等方法，定量研究免疫力的層次性、涌現(xiàn)性、動態(tài)穩(wěn)定性、自主適應(yīng)性等復(fù)雜系統(tǒng)特點，研究這些特點與免疫分子、細(xì)胞行為或證候表征等的映射關(guān)系，探究免疫復(fù)雜系統(tǒng)運行的主要特征、普適規(guī)律及深層機(jī)制，定量探索免疫力的科學(xué)內(nèi)涵和生物基礎(chǔ)。
5. 基于免疫力數(shù)字解碼的重大疾病預(yù)警。
圍繞腫瘤、自身免疫性疾病等重大疾病的“未病”狀態(tài)，比對病變前后及健康人群的免疫力大數(shù)據(jù)，通過免疫檢測新技術(shù)（如新組學(xué)技術(shù)、流式技術(shù)及其他可視化技術(shù)等）和免疫數(shù)據(jù)智能化分析新方法，挖掘疾病演進(jìn)的特異免疫應(yīng)答模式，鑒定可以表征疾病演進(jìn)的免疫力信號，構(gòu)建免疫力維度的疾病預(yù)警模型并驗證其敏感性和特異性，從免疫力視角發(fā)現(xiàn)重大疾病的早期關(guān)鍵特征，實現(xiàn)重大疾病的早期精準(zhǔn)診斷。
�。ǘ┲攸c支持項目。
圍繞核心科學(xué)問題，以總體科學(xué)目標(biāo)為牽引，立足研究范式創(chuàng)新，對于前期研究基礎(chǔ)積累較好，特別是與本重大研究計劃其它申請項目能夠形成學(xué)科交叉、優(yōu)勢互補(bǔ)且共同對總體科學(xué)目標(biāo)形成重要貢獻(xiàn)的申請項目，將以重點支持項目的方式予以資助，具體研究方向如下：
1. 免疫力大數(shù)據(jù)的標(biāo)準(zhǔn)化獲取與深度挖掘。
建立不同免疫狀態(tài)如健康群體、自身免疫病（如系統(tǒng)性紅斑狼瘡、類風(fēng)濕關(guān)節(jié)炎）、惡性腫瘤（如肺癌、肝癌、結(jié)腸癌、胰腺癌）的中國人群大樣本隊列，獲取并匯交疾病不同階段（如發(fā)生、發(fā)展、治療前后等）的標(biāo)準(zhǔn)化數(shù)據(jù)，完善免疫力多維大數(shù)據(jù)收集的標(biāo)準(zhǔn)與規(guī)范，研發(fā)多尺度免疫力數(shù)據(jù)融合與分析的新方法，發(fā)現(xiàn)疾病發(fā)生發(fā)展等過程中的免疫力特征。
2. 免疫組庫等多樣性特征的數(shù)字化呈現(xiàn)。
建立TCR、BCR和MHC等免疫多樣性大數(shù)據(jù)捕獲新方法（如重輕鏈全長獲取和功能性配對等），發(fā)展免疫組庫大數(shù)據(jù)的編碼規(guī)律深度挖掘、疾病關(guān)鍵特征提取、高維特征信息數(shù)據(jù)降維和多樣性分子功能聚類等關(guān)鍵核心技術(shù)，基于多樣性免疫特征量化表征人體免疫力水平，揭示免疫力多樣性特征與疾病和健康的內(nèi)在關(guān)聯(lián)，刻畫群體和個體免疫力數(shù)字肖像和時空圖譜，從免疫組庫視角揭示人體免疫力多樣性的動態(tài)變化規(guī)律。
3. 跨尺度免疫力大數(shù)據(jù)耦合與群體免疫力特征解析。
系統(tǒng)整合多中心多來源的數(shù)據(jù)，開展多尺度免疫力大數(shù)據(jù)耦合、分析等新方法輔助臨床樣本隊列分析的研究，為多中心多來源的數(shù)據(jù)提供生信分析與驗證等支撐�；隈詈系亩嘀行臄�(shù)據(jù)，研究不同年齡、性別、體質(zhì)和遺傳背景的人群免疫力多樣性和差異性，創(chuàng)建人群免疫力特征圖譜，開展基于免疫力干預(yù)的健康維護(hù)及疾病防治新策略及新措施研究，實現(xiàn)群體層面免疫力的健康監(jiān)測與干預(yù)。
�。ㄈ┘身椖�。
建立一種高致死性惡性腫瘤前瞻性多中心隊列及健康對照隊列，嚴(yán)格按照數(shù)據(jù)標(biāo)準(zhǔn)（詳見附件1）采集并匯交腫瘤及外周血匹配的免疫力大數(shù)據(jù)，揭示敏感性高的腫瘤早期免疫力特征，建立準(zhǔn)確度高、泛化能力強(qiáng)的腫瘤早期診斷人工智能模型并驗證其效能，探索模型可解釋性，挖掘腫瘤發(fā)生、進(jìn)展、治療響應(yīng)與免疫力重塑的內(nèi)在科學(xué)規(guī)律與生物學(xué)基礎(chǔ)。
具體要求如下：
1. 臨床中心數(shù)目不少于5個；
2. 疾病隊列人數(shù)不少于1000例；
3. 健康對照隊列人數(shù)不少于300例；
4. 腫瘤及外周血匹配例數(shù)不少于300例；
5. 鼓勵采集包括新輔助治療等治療前后對照樣本。
四、2024年度資助計劃
2024年度擬資助培育項目10- 15項，資助直接費用資助強(qiáng)度約為80萬元/項，資助期限為3年，培育項目申請書中研究期限應(yīng)填寫“2025年1月1日- 2027年12月31日”；擬資助重點支持項目4- 5項，資助直接費用資助強(qiáng)度約為300萬元/項，資助期限為4年，重點支持項目申請書中研究期限應(yīng)填寫“2025年1月1日- 2028年12月31日”；擬資助集成項目1項，資助直接費用資助強(qiáng)度約1300萬元/項，資助期限為3年，集成項目申請書中研究期限應(yīng)填寫“2025年1月1日- 2027年12月31日”。
五、申請要求及注意事項
�。ㄒ唬┥暾垪l件。
本重大研究計劃項目申請人應(yīng)當(dāng)具備以下條件：
1. 具有承擔(dān)基礎(chǔ)研究課題的經(jīng)歷；
2. 具有高級專業(yè)技術(shù)職務(wù)（職稱）。
在站博士后研究人員、正在攻讀研究生學(xué)位以及無工作單位或者所在單位不是依托單位的人員不得作為申請人進(jìn)行申請。
（二）限項申請規(guī)定。
執(zhí)行《2024年度國家自然科學(xué)基金項目指南》“申請規(guī)定”中限項申請規(guī)定的相關(guān)要求。
�。ㄈ┥暾埑绦颉�
1. 申請人應(yīng)根據(jù)本重大研究計劃擬解決的核心科學(xué)問題和項目指南公布的擬資助研究方向，自行擬定項目名稱、科學(xué)目標(biāo)、研究內(nèi)容、技術(shù)路線和直接費用等。
2. 本重大研究計劃項目實行無紙化申請，申請人應(yīng)當(dāng)按照科學(xué)基金網(wǎng)絡(luò)信息系統(tǒng)中重大研究計劃項目的填報說明與撰寫提綱要求在線填寫和提交電子申請書及附件材料。申請書提交日期為2024年5月16日- 5月23日16時。
3. 申請書中的資助類別選擇“重大研究計劃”，亞類說明選擇“培育項目”、“重點支持項目”或“集成項目”，附注說明選擇“免疫力數(shù)字解碼”，受理代碼選擇T03，根據(jù)申請的具體研究內(nèi)容選擇不超過5個申請代碼。
培育項目和重點支持項目的合作研究單位不得超過2個。集成項目的合作研究單位不得超過4個。
4. 申請人在“立項依據(jù)與研究內(nèi)容”部分，首先明確申請對應(yīng)本項目指南中的資助研究方向，以及對解決本重大研究計劃核心科學(xué)問題、實現(xiàn)本重大研究計劃科學(xué)目標(biāo)的貢獻(xiàn)。
如果申請人已經(jīng)承擔(dān)與本重大研究計劃相關(guān)的其他科技計劃項目，應(yīng)當(dāng)在申請書正文的“研究基礎(chǔ)與工作條件”部分論述申請項目與其他相關(guān)項目的區(qū)別與聯(lián)系。
�。ㄋ模┥暾堊⒁馐马棥�
申請人和依托單位應(yīng)當(dāng)認(rèn)真閱讀并執(zhí)行本項目指南、《2024年度國家自然科學(xué)基金項目指南》和《關(guān)于2024年度國家自然科學(xué)基金項目申請與結(jié)題等有關(guān)事項的通告》中相關(guān)要求。
1. 依托單位應(yīng)當(dāng)按照要求完成依托單位承諾、組織申請以及審核申請材料等工作。在2024年5月23日16時前通過信息系統(tǒng)逐項確認(rèn)提交本單位電子申請書及附件材料，并于5月24日16時前在線提交本單位項目申請清單。
2. 為實現(xiàn)重大研究計劃總體科學(xué)目標(biāo)和多學(xué)科集成，獲得資助的項目負(fù)責(zé)人應(yīng)當(dāng)承諾遵守相關(guān)數(shù)據(jù)和資料管理與共享的規(guī)定（詳見附件數(shù)據(jù)標(biāo)準(zhǔn)和數(shù)據(jù)安全管理要求），項目執(zhí)行過程中應(yīng)關(guān)注與本重大研究計劃其他項目之間的相互支撐關(guān)系。
3. 為強(qiáng)化頂層設(shè)計，突出本重大研究計劃創(chuàng)新研究范式和管理模式，申請人須按照指南要求將數(shù)據(jù)采集和匯交（每半年）的目標(biāo)、計劃和承諾作為附件上傳，并附本人簽字和依托單位蓋章，否則項目申請將不予受理。參考模板可見本重大研究計劃數(shù)據(jù)平臺https://ngdc.cncb.ac.cn/idp/。
4. 為加強(qiáng)項目的學(xué)術(shù)交流，促進(jìn)項目群的形成和多學(xué)科交叉與集成，本重大研究計劃將每年舉辦一次資助項目的年度學(xué)術(shù)交流會，并將不定期地組織相關(guān)領(lǐng)域的學(xué)術(shù)研討會。獲資助項目負(fù)責(zé)人須參加本重大研究計劃指導(dǎo)專家組和管理工作組所組織的上述學(xué)術(shù)交流活動。
�。ㄎ澹┳稍兎绞�。
國家自然科學(xué)基金委員會交叉科學(xué)部三處
聯(lián)系電話：010-62327096
附件1
數(shù)據(jù)標(biāo)準(zhǔn)
所有項目產(chǎn)生的數(shù)據(jù)須有完備的患者臨床信息及匹配的高通量組學(xué)數(shù)據(jù)(數(shù)據(jù)類型見下文)�；颊吲R床信息包括個體健康體檢信息和疾病診斷、治療、預(yù)后等隨訪信息。項目負(fù)責(zé)人必須依照指南要求標(biāo)準(zhǔn)提供數(shù)據(jù)。項目申請書須描述樣本數(shù)量及年度數(shù)據(jù)產(chǎn)生計劃，數(shù)據(jù)的樣本數(shù)量與數(shù)據(jù)規(guī)范將被納入評審和考核標(biāo)準(zhǔn)。
一、樣本收集要求
腫瘤樣本須有腫瘤組織和血液樣本。樣本須有準(zhǔn)確的臨床病理信息，包括診斷、治療、預(yù)后等隨訪信息，須配備病理切片H&E染色結(jié)果。若有剩余樣本，可冷凍保存以供后期實驗驗證。其他疾病如自身免疫病等疾病樣本根據(jù)疾病特點和檢測手段取樣，具體要求可參考腫瘤樣本。要求如下：
1. 樣本采集標(biāo)準(zhǔn)
1.1 組織標(biāo)本：組織標(biāo)本應(yīng)盡量去除壞死組織、血漬污物等可能影響檢測結(jié)果的成分，根據(jù)不同的研究目的進(jìn)行OCT包埋、福爾馬林固定、液氮速凍、組織解離等初步處理，以上步驟應(yīng)在標(biāo)本離體60分鐘內(nèi)完成。腫瘤標(biāo)本應(yīng)包括無壞死的腫瘤組織，其他類型組織標(biāo)本如淋巴結(jié)須選取有代表性的病變組織區(qū)域，組織標(biāo)本的質(zhì)量須至少滿足基礎(chǔ)型數(shù)據(jù)的實驗需求；
1.2 外周血樣本：按照不同的實驗要求收集相應(yīng)量的外周靜脈血標(biāo)本，采集量須滿足基礎(chǔ)型數(shù)據(jù)實驗需求。依據(jù)實驗需要對樣本進(jìn)行分離、凍存等處理，血漿或血清的提取須在30分鐘內(nèi)完成，-80℃保存。其他相應(yīng)操作如免疫細(xì)胞分選等應(yīng)在采樣后12小時內(nèi)完成。
2. 樣本的質(zhì)量控制
2.1 腫瘤組織：腫瘤組織質(zhì)量不低于0.5克，腫瘤樣品純度不低于60%，腫瘤組織壞死率小于20%。腫瘤組織須有病理切片以準(zhǔn)確判斷腫瘤組織類型和組織學(xué)特征。其他組織要求參考腫瘤組織的質(zhì)量控制標(biāo)準(zhǔn)；
2.2 血液樣本：無凝血和溶血等情況，如進(jìn)行免疫細(xì)胞分選，每例分離出的PBMC數(shù)量應(yīng)大于8×106，T細(xì)胞數(shù)量大于3×106，B細(xì)胞數(shù)量大于1×106，細(xì)胞存活率大于95%。
3. 樣本的運輸：使用專用保存液、干冰或者液氮進(jìn)行組織樣本及外周血標(biāo)本的運輸。
4. 樣品的保存：凍存于-80℃冰箱或者液氮中，須分裝保存，避免反復(fù)凍融。
5. 樣本必須提供詳細(xì)的臨床病理信息，具體要求如下：
5.1樣本采集對象的可追溯唯一ID（如住院號等）；
5.2 樣本采集對象的病理類型、病理分期（如TNM分期）、病理切片編號、診斷時間、實驗室檢查結(jié)果、影像學(xué)報告等；
5.3 樣本采集時間、地點、采集方式（活檢/手術(shù)切除等）、樣本運輸保存方式（冷凍組織、冰凍切片、石蠟切片等）、樣本量（克、毫升）、樣本純度、組織壞死率；
5.4組織樣本及血液樣本所作檢測名稱、檢測技術(shù)路徑、檢測數(shù)據(jù)報告。
二、臨床信息數(shù)據(jù)類型
可追溯唯一識別ID、性別、年齡、民族、地區(qū)、血型、身高、體重、過敏史、惡性腫瘤家族史、免疫疾病家族史、感染史、吸煙史、飲酒史等；實驗室檢查（樣本采集時）、影像學(xué)檢查、病理檢查報告、治療情況和預(yù)后情況等，特別是隨訪信息和治療響應(yīng)情況。
三、高通量組學(xué)數(shù)據(jù)類型
1. 外周血
TCR-Seq、BCR-Seq、單細(xì)胞多組學(xué)檢測技術(shù)（scRNA-seq、scATAC-seq、scTCR-seq、scBCR-seq），鼓勵獲取TCRαβ鏈配對數(shù)據(jù)、BCR輕重鏈配對數(shù)據(jù)、以及對應(yīng)抗原的匹配數(shù)據(jù)，鼓勵通過CyTOF等方法獲得淋巴細(xì)胞精細(xì)分群數(shù)據(jù)。
2. 組織樣本
TCR-Seq、BCR-Seq、WES（包括組織樣本和對應(yīng)個體外周血）、RNA-Seq、單細(xì)胞多組學(xué)檢測技術(shù)（scRNA-seq、scATAC-seq、scTCR-seq、scBCR-seq），鼓勵獲取TCRαβ鏈配對數(shù)據(jù)、BCR輕重鏈配對數(shù)據(jù)、以及對應(yīng)抗原的匹配數(shù)據(jù)，鼓勵通過CyTOF等方法獲得淋巴細(xì)胞精細(xì)分群數(shù)據(jù)。
四、數(shù)據(jù)質(zhì)控標(biāo)準(zhǔn)
1. bulk TCR/BCR測序數(shù)據(jù)標(biāo)準(zhǔn)：外周血單樣本clonotypes平均值不低于100,000種，組織樣本clonotypes平均值不低于10,000種，重鏈和輕鏈各不少于1,000,000讀數(shù)，單樣本測序量不低于2Gbp （其中有效clonotype的定義為：能夠組裝出全長氨基酸序列且不包含終止密碼子，具有明確的胚系V和J基因信息，同時CDR3區(qū)域含有典型的保守序列）。
2. bulk RNA-Seq測序標(biāo)準(zhǔn)：DV200不低于50%，檢測覆蓋不低于50M reads。
3. WES測序標(biāo)準(zhǔn)：單堿基覆蓋率不低于100X，檢測盒覆蓋不低于32MB。
4. 單細(xì)胞檢測技術(shù)指標(biāo)：
4.1 scRNA-seq：測序指標(biāo)（有效barcodes不低于75%，有效UMIs不低于75%，RNA read Q30不低于75%）；細(xì)胞指標(biāo)（單個樣本細(xì)胞數(shù)不少于5000個，平均每個細(xì)胞的測序read pairs數(shù)大于20000，單個細(xì)胞基因中位數(shù)大于1000）；
4.2 scTCR-seq/scBCR-seq：平均每個細(xì)胞所測得的VDJ文庫read pairs數(shù)不低于5000，RNA read Q30 不低于75%，有效barcodes不低于75%；細(xì)胞指標(biāo)（3000-80000個細(xì)胞/芯片）；
4.3 scATAC-seq: 測序指標(biāo)（測序read pairs不小于25000，有效barcodes不低于75% ，barcode Q30大于65%，read1/2 Q30大于65%，樣本指數(shù)的Q30大于90%）；細(xì)胞指標(biāo)（單個樣本細(xì)胞數(shù)不少于5000個，高質(zhì)量測序片段大于40%）。
五、其他要求
1. 申請人須嚴(yán)格遵守《中華人民共和國生物安全法》《中華人民共和國人類遺傳資源管理條例》等有關(guān)規(guī)定，并嚴(yán)格遵守醫(yī)學(xué)倫理和患者知情同意等規(guī)范要求。涉及人類遺傳資源研究的項目申請書中應(yīng)提供所在單位或上級主管單位倫理委員會的審核證明（電子申請書應(yīng)附掃描件），否則將不予受理。
2. 獲資助的項目須按要求進(jìn)行相關(guān)科學(xué)數(shù)據(jù)采集，并將原始數(shù)據(jù)每半年上傳至本計劃指定的數(shù)據(jù)平臺（https://ngdc.cncb.ac.cn/idp/）。
附件2
數(shù)據(jù)安全
為加強(qiáng)和規(guī)范科學(xué)數(shù)據(jù)管理，凡獲資助的項目負(fù)責(zé)人須承諾遵循如下數(shù)據(jù)安全管理要求，明確責(zé)任主體，保障科學(xué)數(shù)據(jù)的統(tǒng)一匯交、開放共享及安全利用。
一、責(zé)任主體和職責(zé)
1.項目負(fù)責(zé)人是數(shù)據(jù)匯交的責(zé)任主體，任何利用我國人類遺傳資源開展科學(xué)研究（含國際合作研究）的項目，須遵守《中華人民共和國人類遺傳資源管理條例》等國家法律法規(guī)和相關(guān)要求1，包括但不限于上述管理條例、醫(yī)學(xué)倫理、患者知情同意等。
2.本重大研究計劃設(shè)立的指導(dǎo)專家組（以下簡稱專家組），負(fù)責(zé)其資助項目所產(chǎn)生數(shù)據(jù)的統(tǒng)籌管理，總體協(xié)調(diào)各項目的數(shù)據(jù)規(guī)范管理和共享共用，推進(jìn)實現(xiàn)本重大研究計劃的總體目標(biāo)。
3.本重大研究計劃指定的免疫力數(shù)據(jù)管理平臺（以下簡稱數(shù)據(jù)管理平臺），作為科學(xué)數(shù)據(jù)管理方負(fù)責(zé)數(shù)據(jù)的存儲歸檔和安全管理，在專家組指導(dǎo)和協(xié)調(diào)下，定期公布本重大研究計劃所產(chǎn)生的數(shù)據(jù)，推動本重大研究計劃的數(shù)據(jù)統(tǒng)一匯交管理和安全共享利用。
二、數(shù)據(jù)匯交
1. 凡產(chǎn)生數(shù)據(jù)的資助項目，項目負(fù)責(zé)人須明確擬產(chǎn)出數(shù)據(jù)的類型、數(shù)據(jù)量、匯交時間、訪問權(quán)限等，且須按照年度工作計劃向數(shù)據(jù)管理平臺匯交數(shù)據(jù)，所有數(shù)據(jù)的匯交不晚于項目結(jié)題時間，數(shù)據(jù)共享訪問權(quán)限由項目負(fù)責(zé)人設(shè)定。
2. 項目負(fù)責(zé)人須提供樣本采集信息、個體臨床信息及匹配的高通量組學(xué)數(shù)據(jù)等，準(zhǔn)確且詳細(xì)的描述相關(guān)元數(shù)據(jù)，完成基礎(chǔ)型數(shù)據(jù)及其他拓展性數(shù)據(jù)的原始數(shù)據(jù)和元數(shù)據(jù)（包括采樣和臨床）匯交。匯交數(shù)據(jù)的質(zhì)量和體量是年度考核的重要依據(jù)。
3. 匯交共享數(shù)據(jù)如涉及人類遺傳資源數(shù)據(jù)，項目負(fù)責(zé)人在提交數(shù)據(jù)前，應(yīng)對個人信息采取去標(biāo)識化處理，以確保隱私保護(hù)和安全利用。在數(shù)據(jù)提交時，應(yīng)明確說明數(shù)據(jù)目標(biāo)使用者（即僅限國內(nèi)用戶或國內(nèi)外用戶均可）及數(shù)據(jù)使用范圍等相關(guān)信息。
三、數(shù)據(jù)共享
1. 數(shù)據(jù)共享遵循“開放為常態(tài)，不開放為例外”原則，數(shù)據(jù)管理平臺為本重大研究計劃各項目提供數(shù)據(jù)統(tǒng)一匯交和安全共享服務(wù)。
2. 數(shù)據(jù)在開放共享前，項目負(fù)責(zé)人應(yīng)遵循《人類遺傳資源管理條例實施細(xì)則》的相關(guān)規(guī)定，完成人類遺傳資源信息的備案備份和事先報告。
3. 本重大研究計劃的數(shù)據(jù)管理平臺提供兩種共享方式：公開訪問和受控訪問。公開訪問，即無需訪問權(quán)限或申請程序，用戶可自由獲取和使用已公開發(fā)布的數(shù)據(jù)及對應(yīng)的元數(shù)據(jù)信息；受控訪問，即采用“申請-審核”制獲取數(shù)據(jù)訪問權(quán)限，數(shù)據(jù)使用者在數(shù)據(jù)管理平臺向數(shù)據(jù)對應(yīng)的項目負(fù)責(zé)人提出使用申請，項目負(fù)責(zé)人審核申請并反饋審核意見。
4. 為加強(qiáng)本重大研究計劃各項目之間的數(shù)據(jù)共享利用及其相互支撐，申請使用數(shù)據(jù)的項目負(fù)責(zé)人須在數(shù)據(jù)管理平臺中提出數(shù)據(jù)使用申請并明確數(shù)據(jù)用途，數(shù)據(jù)匯交的項目負(fù)責(zé)人對申請進(jìn)行審核。專家組統(tǒng)籌協(xié)調(diào)各方在數(shù)據(jù)共享、整合利用、專利論文發(fā)表等方面的權(quán)責(zé)、義務(wù)等事項。
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