
PCR 簡(jiǎn)單來(lái)說(shuō)就是在合適條件下,熱變性-復(fù)性-延伸過(guò)程的不斷重復(fù)。整個(gè)過(guò)程有點(diǎn)像是織圍巾,但也不完全是這樣?棁恚≒CR)所必須的原材料有這樣幾個(gè)元素織樣(模板)、起針(引物對(duì))、毛線(dNTP)和針(Taq酶以及緩沖體系)。
首先要將織樣拆解開(通過(guò)95℃高溫,將DNA雙鏈拉鏈狀解鏈),然后將實(shí)現(xiàn)織好的起針配合在織樣上(通過(guò)退火將合成的引物結(jié)合在單鏈的模板上),按照織樣(模板),沿著起針(引物)用毛衣針(Taq酶)將毛線(dNTP)一針針連接上去(72℃下延伸擴(kuò)增)。
通過(guò)對(duì)所有織樣(包括原先的模板及新形成的模板)的拆解(解鏈)及新的起針(引物)搭配(結(jié)合)、編織(Taq酶擴(kuò)增)這樣循環(huán)n次后,圍巾的數(shù)量就以2的n次方(產(chǎn)物量就以2的n次方)增多了。
PCR試驗(yàn)最早是以Klenow片段進(jìn)行擴(kuò)增的,由于這種酶高溫會(huì)變性,所以最早的PCR實(shí)驗(yàn)員是很苦逼的,每個(gè)循環(huán)都需要開蓋、加酶、換水浴鍋,這樣35個(gè)循環(huán)……后來(lái)發(fā)現(xiàn)了Taq酶之后,事情就簡(jiǎn)單了,由于Taq酶可以應(yīng)付高溫環(huán)境,于是就產(chǎn)生了新的PCR儀,也就是現(xiàn)在的定時(shí)變溫金屬浴。還有別忘了加熱蓋,沒(méi)有熱蓋的話,管內(nèi)高溫會(huì)導(dǎo)致液體全都蒸發(fā)到管蓋上,就沒(méi)法擴(kuò)增了。
PCR的技巧,關(guān)鍵的PCR技巧在于引物的設(shè)計(jì),這個(gè)我們以后還可以深入解釋。但有的時(shí)候,如果要克隆固定片段,引物設(shè)計(jì)位置是定死的,只能微調(diào),那什么引物設(shè)計(jì)軟件都是白搭。
其次的關(guān)鍵是鎂離子濃度,鎂離子是Taq酶的激活劑,濃度過(guò)低會(huì)導(dǎo)致PCR產(chǎn)量下降,濃度過(guò)高則會(huì)產(chǎn)生非特異性擴(kuò)增。
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