
近十余年來,針對融合基因的靶向治療進展迅速,為特定融合基因陽性患者帶來顯著臨床獲益。然而,基因融合形成機制多樣,檢測方法眾多,不同方法各有優(yōu)缺點,在臨床分子檢測中相對復(fù)雜。
本文基于國內(nèi)外臨床檢測實踐,達(dá)成非小細(xì)胞肺癌融合基因檢測的中國專家共識,以規(guī)范融合基因的分子檢測,精準(zhǔn)篩選適合特定靶向治療的患者人群。
一、融合基因包括哪些?
基于靶向藥物的可及性,共識將融合基因分為必檢基因與擴展基因兩類。
必檢基因包括間變性淋巴瘤激酶(ALK)、c‑ros 原癌基因1(ROS1)、轉(zhuǎn)染重排原癌基因(RET)和神經(jīng)營養(yǎng)因子受體酪氨酸激酶(NTRK)。
擴展基因主要包括神經(jīng)調(diào)節(jié)蛋白(NRG)、成纖維細(xì)胞生長因子受體(FGFR)、間質(zhì)表皮轉(zhuǎn)化因子(MET)、表皮生長因子受體(EGFR)、人類表皮生長因子受體2(HER2)和鼠類肉瘤濾過性毒菌致癌同源體B1(BRAF)等(表1)。
各融合基因在NSCLC中的發(fā)生頻率差異較大。需要特別說明的是,作為NSCLC驅(qū)動基因變異譜的一部分,盡管融合基因檢測方法有其特性,但在臨床實踐中,檢測策略的優(yōu)化需綜合考慮其他驅(qū)動基因的檢測。
二、融合基因檢測適用人群標(biāo)本類型
推薦意見1:推薦病理學(xué)診斷為肺腺癌(包括含腺癌成分)的晚期初治NSCLC患者及靶向藥物治療后耐藥的NSCLC患者進行融合基因檢測(強烈推薦);建議經(jīng)活檢組織病理學(xué)診斷為非腺癌的晚期NSCLC患者及術(shù)后明確為浸潤性腺癌的Ⅱ~Ⅲ期NSCLC患者進行融合基因檢測(推薦)。
推薦意見2:推薦首選腫瘤組織學(xué)標(biāo)本進行融合基因檢測,無法獲取足夠腫瘤組織學(xué)標(biāo)本時,可選擇細(xì)胞學(xué)標(biāo)本。在檢測融合基因前,由專業(yè)的病理醫(yī)師對組織或細(xì)胞學(xué)標(biāo)本進行腫瘤細(xì)胞含量評估(強烈推薦);無法獲取足夠腫瘤組織學(xué)或細(xì)胞學(xué)標(biāo)本時,建議選擇液體活檢作為補充檢測手段(推薦)。
三、融合基因檢測的常用方法
推薦意見3:應(yīng)根據(jù)送檢標(biāo)本類型、腫瘤細(xì)胞含量、標(biāo)本質(zhì)量、所檢融合基因特點、平臺可及性、檢測周期及費用等因素,合理選擇檢測平臺及方式,必要時可多平臺互補和驗證(強烈推薦)。
目前常用的融合基因檢測方法包括熒光原位雜交(FISH)、免疫組織化學(xué)(IHC)、即時熒光定量聚合酶鏈反應(yīng)(qRT‑PCR)和二代測序等。
1.FISH:是通過熒光標(biāo)記的探針與細(xì)胞核內(nèi)的DNA靶序列雜交,并在熒光顯微鏡下觀察分析基因擴增或融合變異的一種分子檢測技術(shù),一般被認(rèn)為是檢測基因擴增和融合的“金標(biāo)準(zhǔn)”,但也存在一定的局限性。如并非所有檢測到的融合均會產(chǎn)生可表達(dá)的融合RNA,分離探針可能會遺漏較小的染色體內(nèi)重排導(dǎo)致假陰性結(jié)果,無法確定和區(qū)分不同的融合基因變異亞型等。
2.IHC:是利用抗原抗體反應(yīng)和化學(xué)顯色原理,檢測組織或細(xì)胞學(xué)切片中特定蛋白表達(dá)的技術(shù)。IHC檢測靈敏度高、成本低、檢測時間短、易于自動化,但其準(zhǔn)確性取決于檢測的融合蛋白是否有經(jīng)過驗證的抗體,如Ventana-D5F3 IHC檢測肺腺癌患者ALK融合的準(zhǔn)確性高,而ROS1和NTRK陽性IHC結(jié)果尚需其他檢測方法驗證。
3.qRT-PCR:可在RNA水平檢測NSCLC中的融合RNA,靈敏度高、檢測時間短,但僅限于檢測引物設(shè)計范圍內(nèi)的已知融合,無法檢出未知融合。此外,該方法檢測結(jié)果的準(zhǔn)確性高度依賴標(biāo)本RNA的質(zhì)量。
4.靶向二代測序:可以通過大規(guī)模平行測序的方法,對引物或探針設(shè)計范圍內(nèi)的區(qū)域同時進行多個融合基因檢測。根據(jù)核酸投入物的不同,靶向二代測序可在DNA或RNA水平檢測基因融合。
四、融合基因的共性及檢測策略
推薦意見4:DNA層面檢出的罕見融合伴侶、外顯子斷點融合及基因間融合應(yīng)在RNA或蛋白水平進一步驗證(強烈推薦)。
推薦意見5:DNA水平檢測驅(qū)動基因為陰性的NSCLC患者建議在RNA或蛋白水平進一步檢測基因融合,尤其是年輕、女性、不吸煙、TMB低的黏液/實性肺腺癌患者(推薦)。
五、NSCLC常見融合基因的特性
推薦意見6:對于必檢融合基因,推薦使用二代測序或qRT‑PCR進行檢測(強烈推薦),建議使用FISH進行檢測(推薦)。
推薦意見7:推薦使用IHC檢測ALK融合(強烈推薦),建議IHC僅用于ROS1和NTRK融合初篩,陽性結(jié)果需其他平臺驗證(推薦);不建議IHC用于RET融合檢測(推薦)。
推薦意見8:建議使用二代測序檢測擴展融合基因(推薦)。
六、融合基因檢測的推薦方法及流程
推薦意見9:基于靶點基因變異全面檢測的必要性及平臺的適用性,晚期初治NSCLC患者應(yīng)通過二代測序或qRT‑PCR進行包括融合基因在內(nèi)的多基因檢測(強烈推薦)。
推薦意見10:靶向治療耐藥后再次活檢的患者建議使用二代測序同時檢測多種基因變異(推薦)
推薦意見11:術(shù)后診斷為浸潤性腺癌的Ⅱ~Ⅲ期NSCLC患者建議通過IHC檢測ALK融合,或通過qRT‑PCR或二代測序進行多基因檢測(推薦)。
七、臨床實踐中其他檢測注意事項
推薦意見12:如果不同檢測平臺的檢測結(jié)果不一致,推薦用第3種平臺進行驗證(強烈推薦)。
參考文獻:
中國抗癌協(xié)會腫瘤病理專業(yè)委員會, 中華醫(yī)學(xué)會腫瘤學(xué)分會肺癌專家委員會, 國家病理質(zhì)控中心. 非小細(xì)胞肺癌融合基因檢測臨床實踐中國專家共識(2023版)[J]. 中華病理學(xué)雜志, 2023, 52(6): 565-573.









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