
近年來,隨著醫(yī)療技術(shù)的發(fā)展和大眾對(duì)身體健康的關(guān)注,腫瘤早篩早診的觀念和意識(shí)也在逐漸加強(qiáng),期望做到早發(fā)現(xiàn)、早治療,實(shí)現(xiàn)早康復(fù)的目標(biāo)。與傳統(tǒng)腫瘤篩查技術(shù)相比,液體活檢是目前研究的熱點(diǎn),其在腫瘤的早期診斷、精準(zhǔn)治療、進(jìn)展與轉(zhuǎn)移、異質(zhì)性與耐藥性以及預(yù)后評(píng)估等領(lǐng)域發(fā)揮重要的協(xié)助作用,未來有望成為腫瘤精準(zhǔn)診斷與治療的突破口。
液體活檢橫空出世后,便被《麻省理工大學(xué)科技評(píng)論》評(píng)選為“2015年十大突破技術(shù)”,正在從研究走向臨床和市場(chǎng)。因?yàn)槠淠軌驈浹a(bǔ)腫瘤組織活檢的諸多弊端,液體活檢被視為引領(lǐng)腫瘤檢測(cè)、診斷和動(dòng)態(tài)監(jiān)測(cè)的革命性技術(shù),但如何將其轉(zhuǎn)化為規(guī)范統(tǒng)一的臨床工具,業(yè)內(nèi)仍在努力進(jìn)行嘗試。
初識(shí)液體活檢技術(shù)
液體活檢是一種新興的非侵入性檢測(cè)手段,是指提取人體中的非固體組織樣本進(jìn)行檢測(cè)。腫瘤細(xì)胞在發(fā)生凋亡或轉(zhuǎn)移等過程中會(huì)將與腫瘤相關(guān)的信息如DNA/RNA等小分子物質(zhì)釋放到體液系統(tǒng)中,通過檢測(cè)這些標(biāo)志性分子,可以發(fā)現(xiàn)腫瘤的早期發(fā)生/復(fù)發(fā)、輔助診斷分型及治療方案調(diào)整等。
廣義的液體活檢包括對(duì)血液、尿液、唾液等所有體液以及糞便的收集和檢測(cè)。主流液體活檢技術(shù)主要使用循環(huán)腫瘤細(xì)胞(CTCs)或者非細(xì)胞DNA(cfDNA)進(jìn)行檢測(cè)。液體活檢與傳統(tǒng)組織檢測(cè)相比有諸多優(yōu)勢(shì),具有無創(chuàng)性、患者依從性好、可動(dòng)態(tài)監(jiān)測(cè)等優(yōu)點(diǎn),并克服了腫瘤的異質(zhì)性。
(液體活檢的臨床應(yīng)用)(來源:American Association for Cancer Research)
液體活檢的檢測(cè)對(duì)象主要為體液標(biāo)本中的核酸、細(xì)胞和外囊泡。核酸指cfDNA/cfRNA(circulating free DNA/RNA,循環(huán)游離DNA/RNA,包括ctDNA/ctRNA);細(xì)胞指 CTCs(Circulating Tumor Cells,循環(huán)腫瘤細(xì)胞);外囊泡指含有小RNA、mRNA和DNA的細(xì)胞外微囊泡,包括外泌體(Exosomes)。
(液體活檢的檢測(cè)對(duì)象)
液體活檢的前提是找到有“意義”的微量ctDNA(circulating tumor DNA)。實(shí)驗(yàn)室常用的ctDNA 檢測(cè)技術(shù)包括擴(kuò)增受阻突變體系(amplification refractory mutation system,ARMS)、二代測(cè)序(next-generation sequencing,NGS)、數(shù)字PCR(digital PCR,dPCR)和核酸質(zhì)譜檢測(cè)等。在實(shí)際樣本中,ctDNA的含量?jī)H占cfDNA的0.1%-5%,故要求檢測(cè)技術(shù)有足夠低的檢出限和靈敏度,才能滿足液體活檢的檢測(cè)需求。
用于液體活檢的標(biāo)本有多種,包括全血、血漿、胸/腹腔積液、尿液、腦脊液、唾液等。檢測(cè)時(shí),根據(jù)腫瘤的具體發(fā)生部位、轉(zhuǎn)移情況的復(fù)雜性、不同體液標(biāo)本的特征,應(yīng)優(yōu)先選擇液體活檢靶標(biāo)容易檢出部位的標(biāo)本。血漿ctDNA 樣本適用于檢測(cè)多種來源的腫瘤,已在肺癌、乳腺癌、淋巴瘤等腫瘤的液體活檢中有所應(yīng)用。
體液中存在較強(qiáng)的背景干擾,加之液體活檢的信息源極其微量,易在分析過程中出現(xiàn)偏差,因此液體活檢對(duì)分析全過程的要求相對(duì)較高,尤其在標(biāo)本預(yù)處理步驟需避免背景細(xì)胞或核酸對(duì)CTC和ctDNA的稀釋作用,同時(shí)進(jìn)一步防止對(duì)CTC 的破壞和對(duì)ctDNA的片段化及降解,導(dǎo)致最終假陰性結(jié)果。
(體液標(biāo)本選擇一般規(guī)律)(來源:《液體活檢在臨床腫瘤診療應(yīng)用和醫(yī)學(xué)檢驗(yàn)實(shí)踐中的專家共識(shí)》)
液體活檢發(fā)展歷程
液體活檢的發(fā)展歷程主要?dú)v經(jīng)四個(gè)階段:科學(xué)探索期(20世紀(jì)90年代前)、科學(xué)發(fā)展期(20世紀(jì)90年代)、產(chǎn)業(yè)成長(zhǎng)期(2000-2010年)、產(chǎn)業(yè)爆發(fā)期(2010年至今)。
1869年,澳大利亞醫(yī)生Thomas Ashworth在剛?cè)ナ赖哪[瘤患者血液中發(fā)現(xiàn)和腫瘤細(xì)胞相似的細(xì)胞;
1983年,Immunicon公司發(fā)明第一代采用磁珠捕獲法的CTC檢測(cè)技術(shù);
1994年,Immunicon公司開創(chuàng)商業(yè)液體活檢,很快該公司被強(qiáng)生子公司Veridex收購(gòu);
2000年,Veridex推出一款名為CellSearch的商業(yè)液體活檢測(cè)試;
2004年,Cell Search系統(tǒng)獲得美國(guó)FDA批準(zhǔn),用于轉(zhuǎn)移性結(jié)直腸癌、乳腺癌和前列腺癌的臨床檢測(cè);
2011年,利用ctDNA檢測(cè)基因突變獲取腫瘤生物學(xué)信息的技術(shù)被引入液體活檢;
2012年,Cell Search系統(tǒng)獲得CFDA進(jìn)口醫(yī)療器械注冊(cè)批準(zhǔn);
2014年,歐盟EMA批準(zhǔn)ctDNA檢測(cè)EGFR突變可用于易瑞沙的伴隨診斷,標(biāo)志著ctDNA檢測(cè)正式進(jìn)入臨床應(yīng)用;
2015年,液體活檢入選《麻省理工科技評(píng)論》年度十大突破技術(shù)。此后,液體活檢技術(shù)開始高速發(fā)展,外泌體和腫瘤誘導(dǎo)血小板等檢測(cè)也納入液體活檢范疇;
2016年,美國(guó)FDA批準(zhǔn)了基于熒光定量 PCR技術(shù)、可用于肺癌ctDNA突變檢測(cè)的試劑盒;
2018年,中國(guó)國(guó)家藥品監(jiān)督管理局首次批準(zhǔn)血漿EGFR基因突變檢測(cè)用于非小細(xì)胞肺癌患者的臨床評(píng)估,標(biāo)志著我國(guó)液體活檢進(jìn)入了新的發(fā)展階段;
2019年,一種用于檢測(cè)前列腺癌篩查的外泌體液體活檢技術(shù)獲得美國(guó)突破性醫(yī)療器械認(rèn)定;
2020 年,首個(gè)基于二代測(cè)序(NGS)的液體活檢產(chǎn)品獲得美國(guó)FDA批準(zhǔn),用于實(shí)體瘤綜合基因組分析和肺癌伴隨診斷,進(jìn)一步指導(dǎo)臨床治療決策;
2021年,ctDNA液體活檢獲得紐約州衛(wèi)生部臨床實(shí)驗(yàn)室評(píng)估項(xiàng)目的許可,可用于實(shí)體瘤微小殘留病變(MRD)的檢測(cè),拓展了液體活檢的臨床應(yīng)用范圍,標(biāo)志著液體活檢技術(shù)的發(fā)展進(jìn)入了新階段。同年7月,中國(guó)國(guó)家藥品監(jiān)督管理局批準(zhǔn) CytoSorter®循環(huán)上皮細(xì)胞分離儀獲得三類醫(yī)療器械注冊(cè)證;
2022年,來自以色列魏茲曼科學(xué)研究所和希伯來大學(xué)領(lǐng)導(dǎo)的國(guó)際研究團(tuán)隊(duì)開發(fā)了一種基于單分子的液體活檢方法,并發(fā)表于 Nature Biotechnology。
液體活檢市場(chǎng)規(guī)模
2020年,全球液體活檢市場(chǎng)規(guī)模為70.3億美元,預(yù)計(jì)在預(yù)測(cè)期內(nèi)將以13.5%的復(fù)合年增長(zhǎng)率擴(kuò)大。此外,由于癌癥的發(fā)病率不斷上升,加之對(duì)快速、微創(chuàng)診斷測(cè)試的需求增加,也進(jìn)一步推動(dòng)了市場(chǎng)的增長(zhǎng)。
據(jù)美國(guó)癌癥協(xié)會(huì)(American Cancer Society)統(tǒng)計(jì),2021年約有23.5萬人被診斷患有非小細(xì)胞肺癌,約有1/17的男性和1/15的女性在其一生中有患癌癥的風(fēng)險(xiǎn)。因此,在目標(biāo)人群中診斷和根除癌癥的液體活檢篩查需求越來越大。
(來源:Grand View Research)
在液體活檢技術(shù)日趨成熟和癌癥早篩測(cè)試逐漸進(jìn)入市場(chǎng)的背景下,預(yù)計(jì) 。
(來源:灼識(shí)咨詢)
截至2021年,全球有超過40家公司活躍在液體活檢診斷和監(jiān)測(cè)測(cè)試市場(chǎng),液體活檢市場(chǎng)預(yù)計(jì)未來5年的復(fù)合增長(zhǎng)率為29.5%,到 2026年,該市場(chǎng)將超過30 億美元(接近37億美元)。
目前液體活檢的一半收入來自美國(guó),歐洲市場(chǎng)約占25%,亞太市場(chǎng)占12%。相較其他地區(qū),北美擁有更加龐大的投資以及更多駐足本地進(jìn)行開發(fā)測(cè)試的生物技術(shù)公司,同時(shí)還有各種組織協(xié)會(huì),如美國(guó)臨床腫瘤學(xué)會(huì) (ASCO),推動(dòng)了北美液體活檢市場(chǎng)的發(fā)展。
(來源:Kalorama)
2020年,多基因并行分析(NGS)占據(jù)全球市場(chǎng)73%以上的收入份額,在預(yù)測(cè)期內(nèi)將保持其主導(dǎo)地位。NGS技術(shù)可以檢測(cè)可能導(dǎo)致腫瘤發(fā)生的各種突變,并檢測(cè)治療后可能由先前存在的克隆產(chǎn)生的耐藥性機(jī)制。NGS技術(shù)的快速發(fā)展導(dǎo)致高精度測(cè)序的成本顯著降低,此外,NGS相關(guān)企業(yè)推出的創(chuàng)新產(chǎn)品,也在一定程度上推動(dòng)了液體活檢市場(chǎng)的發(fā)展。例如,2021年2月,Twist Bioscience Corp推出了Twist NGS甲基化檢測(cè)系統(tǒng),用于液體活檢癌癥分析和表觀遺傳學(xué)研究。2021年4月,Biodesix宣布計(jì)劃推出基于血液的52基因NGS檢測(cè),以改善其分子檢測(cè)產(chǎn)品組合。
目前,液體活檢生物標(biāo)志物主要有ctDNA、CTC、外泌體檢測(cè)三大類。在生物標(biāo)志物類型層面,ctDNA在2020年全球液體活檢市場(chǎng)中占主導(dǎo)地位,占據(jù)份額為36.68%。近年來,基于ctDNA的液體活檢分析推動(dòng)了癌癥分子診斷和監(jiān)測(cè)的應(yīng)用,能夠精準(zhǔn)判斷腫瘤進(jìn)展、預(yù)后,輔助靶向治療。另外,由于外泌體的發(fā)展勢(shì)頭良好,預(yù)計(jì)一直到2028年,外泌體檢測(cè)市場(chǎng)將以較快的復(fù)合年增長(zhǎng)率擴(kuò)大。
在樣本類型層面,2020年基于血液樣本的液體活檢市場(chǎng)占主導(dǎo)地位,占據(jù)份額超過69%。由于其具有非侵入性、無風(fēng)險(xiǎn)、可減少診斷所需成本和時(shí)間等優(yōu)點(diǎn),液體活檢在癌癥早篩領(lǐng)域迅速成為頗具潛力的工具之一。
(來源:Grand View Research)
液體活檢市場(chǎng)玩家
(一)GRAIL
GRAIL成立于2016年,由Illumina和ARCH Venture Partners 共同投資1億美金而成立,是一家結(jié)合大數(shù)據(jù)分析進(jìn)行癌癥早篩的液體活檢公司。公司利用大規(guī)模的人群測(cè)序數(shù)據(jù)作為樣本,通過生物信息學(xué)和機(jī)器學(xué)習(xí)算法找出與癌癥有關(guān)的突變信號(hào),最終建立具有預(yù)測(cè)作用的癌癥早篩算法。2020年9月,GRAIL向SEC申請(qǐng)?jiān)诩{斯達(dá)克交易所掛牌上市,股票代碼為“GRAL”。兩周后,illumina宣布將以80億美元收購(gòu)GRAIL的股份。
GRAIL旗下的多癌種早期檢測(cè)產(chǎn)品已被美國(guó)FDA批準(zhǔn)為突破性設(shè)備(Breakthrough Devices),2021年推出的液體活檢產(chǎn)品Galleri,可作為一種LDT檢測(cè)用于50歲以上無癥狀人群的癌癥篩查。
(二)Guardant Health
Guardant Health于2012年成立于美國(guó)加州,于2018年10月在紐約納斯達(dá)克交易所上市,是美國(guó)領(lǐng)先的腫瘤液體活檢頭部企業(yè)。公司致力于提供全方位的癌癥液體活檢服務(wù),包括癌癥早期篩查、復(fù)發(fā)監(jiān)測(cè)以及中晚期癌癥患者突變檢測(cè)以用于療法選擇等。
公司的核心產(chǎn)品Guardant360 和Guardant OMNI測(cè)試均獲得美國(guó)FDA突破性醫(yī)療器械認(rèn)證。Guardant360 CDx獲批用于實(shí)體瘤類型的綜合基因組分析,亦可作為奧西替尼的伴隨診斷。Guardant360 CDx此前曾被FDA授予突破性醫(yī)療器械認(rèn)定,旨在加快醫(yī)療器械的發(fā)展,為危及生命或不可逆轉(zhuǎn)的衰弱性疾病或病癥提供有效的治療和診斷。
(三)Foundation Medicine
Foundation Medicine成立于2010年,總部位于美國(guó)馬薩諸塞州,專注于癌癥基因分析檢測(cè),其服務(wù)內(nèi)容包括腫瘤基因分析檢測(cè)、個(gè)性化用藥指導(dǎo)、協(xié)助藥企進(jìn)行新療法開發(fā)及臨床實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)等。2018年6月,羅氏以大約24億美元的價(jià)格完成對(duì)Foundation Medicine的收購(gòu),進(jìn)一步擴(kuò)大了羅氏在腫瘤精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)中的布局。
2017年,F(xiàn)DA批準(zhǔn)Foundation Medicine旗下產(chǎn)品--FoundationOneCDx(F1CDx)用于泛癌種臨床伴隨診斷,這是一款基于NGS的體外診斷產(chǎn)品,能對(duì)結(jié)直腸癌、乳腺癌、卵巢癌和黑色素瘤在內(nèi)的泛癌種進(jìn)行全面伴隨診斷基因檢測(cè)。
(四)Personal Genome Diagnostics
Personal Genome Diagnostics (PGDx)成立于2010年,是一家從事癌癥基因組測(cè)序和分析的基因檢測(cè)公司,由約翰斯·霍普金斯大學(xué)醫(yī)學(xué)院的腫瘤研究專家Luis Diaz和Victor Velculescu聯(lián)合創(chuàng)辦。PGDx致力于開發(fā)新一代高通量測(cè)序和專利算法,識(shí)別癌癥基因組的復(fù)雜變化,并開發(fā)用于癌癥的非侵入性液體活檢技術(shù)。公司實(shí)驗(yàn)室已取得美國(guó)CLIA批準(zhǔn),主要面向醫(yī)生、患者、癌癥研究人員以及抗癌藥物研發(fā)人員,為他們提供晚期癌癥基因組學(xué)分析。
2019年,PGDx公司的腫瘤NGS液體活檢產(chǎn)品elioTM Plasma Resolve獲得歐盟CE批復(fù)上市,彌補(bǔ)了腫瘤基因檢測(cè)市場(chǎng)上僅有NGS組織活檢產(chǎn)品的不足,同時(shí)也宣告NGS液體活檢正式從臨床研究落地到臨床應(yīng)用。
(五)Exosome Diagnostics
Exosome Diagnostics成立于2008年,致力于開發(fā)外泌體相關(guān)技術(shù),利用外泌體的天然濃縮特性,實(shí)現(xiàn)靈敏度高、特異性強(qiáng)的癌癥和其他疾病的基因轉(zhuǎn)錄分析。公司的體液檢測(cè)技術(shù)能提供個(gè)性化的醫(yī)療服務(wù),克服以組織為基礎(chǔ)的診斷和其他液體活檢的局限性。
針對(duì)非小細(xì)胞肺癌,該公司能檢測(cè)與肺癌相關(guān)的T790M耐藥突變、EML4-ALK基因突變及EGFR活化突變,對(duì)非小細(xì)胞肺癌的治療方式及治療過程中方案調(diào)整具有指導(dǎo)意義。針對(duì)前列腺癌,該公司能提供ExoDxProstate(IntelliScore)液體活檢,可以提供癌癥侵襲性等關(guān)鍵信息,還可以持續(xù)監(jiān)測(cè)疾病進(jìn)展,協(xié)助醫(yī)生為病人匹配最佳治療方案。
(六)Twist Bioscience
Twist Bioscience成立于2013年,總部位于美國(guó)舊金山。作為一家合成生物學(xué)公司,主要從事硅基芯片合成DNA生產(chǎn),利用專利技術(shù)大規(guī)模合成DNA、RNA和蛋白質(zhì),用于藥物開發(fā)、基因治療、農(nóng)業(yè)和工業(yè)生物技術(shù)研發(fā)。
2018年,Twist Bioscience成功在納斯達(dá)克掛牌上市,該公司的DNA合成平臺(tái)將傳統(tǒng)的化學(xué)DNA合成反應(yīng)高度微型化,業(yè)務(wù)涉及合成基因、NGS工具、用于藥物發(fā)現(xiàn)和開發(fā)的抗體庫(kù)以及DNA數(shù)據(jù)存儲(chǔ)系統(tǒng)的開發(fā)等。公司旗下用于泛癌種研究的甲基化文庫(kù)制備和靶向富集的 NGS 測(cè)序產(chǎn)品已在全球上市。
(七)Biodesix
Biodesix成立于2005年,是一家分子診斷公司,致力于開發(fā)個(gè)性化醫(yī)療的創(chuàng)新產(chǎn)品。該公司為醫(yī)生提供早期疾病檢測(cè)、監(jiān)測(cè)和治療指導(dǎo)的診斷測(cè)試,以便改善患者的治療效果。
Biodesix通過發(fā)布Nodify CDT擴(kuò)展了其基于血液的液體活檢產(chǎn)品組合,該檢測(cè)方法可以檢測(cè)肺癌患者免疫系統(tǒng)所產(chǎn)生的循環(huán)抗體蛋白,旨在幫助醫(yī)護(hù)人員識(shí)別有癌變風(fēng)險(xiǎn)的高危腫瘤,只需通過抽血活檢就可以診斷在高危患者中偶發(fā)的肺結(jié)節(jié)是否為惡性腫瘤。
結(jié)語
液體活檢在腫瘤早篩、診斷分型、早期復(fù)發(fā)監(jiān)測(cè)等方面具有獨(dú)特優(yōu)勢(shì),通過技術(shù)的不斷改進(jìn),成本不斷降低,未來也將惠及更多患者。但在另一方面,盡管市場(chǎng)潛力巨大,液體活檢仍然存在未突破的局限性,是否將其廣泛應(yīng)用于臨床的爭(zhēng)論不絕于耳。在技術(shù)層面,液體活檢不同平臺(tái)差異較大,生信分析方法不統(tǒng)一,檢測(cè)水平有待提高,限制了液體活檢的分析有效性。在臨床層面,有關(guān)癌癥早期診斷、治療監(jiān)測(cè),相應(yīng)的臨床有效性研究仍然十分匱乏,這些將是液體活檢實(shí)現(xiàn)廣泛應(yīng)用時(shí)需要克服的障礙。
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