
復旦大學附屬腫瘤醫(yī)院傳出消息,該院大腸外一科徐燁教授聯(lián)合精準腫瘤中心胡欣教授,成功繪制出迄今國內(nèi)最大規(guī)模的結(jié)直腸癌基因組變異圖譜,揭示了中國人群結(jié)直腸癌基因組變異特征,并鑒定出其中可精準預測結(jié)直腸癌靶向治療和免疫治療療效的基因組標志物,為結(jié)直腸癌的基礎(chǔ)臨床轉(zhuǎn)化拓寬了思路。相關(guān)研究成果日前在國際權(quán)威學術(shù)期刊《胃腸病學》(影響因子34)發(fā)表。
高化療耐受、易復發(fā)……
結(jié)直腸癌精準治療需優(yōu)化
結(jié)直腸癌是嚴重威脅我國居民生命健康的惡性疾病。“隨著居民生活方式的變化和健康篩查意識的提升,我國結(jié)直腸癌發(fā)病人數(shù)越來越多!毙鞜罱淌诒硎,高化療耐受和高復發(fā)轉(zhuǎn)移率是阻礙結(jié)直腸癌患者獲得長期生存的瓶頸,20%-25%的患者在初診時即伴隨轉(zhuǎn)移,另有30%的I-III期和65%的IV期患者出現(xiàn)復發(fā)或二次轉(zhuǎn)移。
由于結(jié)直腸癌復雜的分子發(fā)病機制,致使其具有高度的腫瘤異質(zhì)性。因此,尋找結(jié)直腸癌個體化腫瘤靶標,探索結(jié)直腸癌的精準治療,對打破結(jié)直腸癌治療瓶頸具有重要意義。
目前,以分子免疫治療、靶向治療等治療方式為代表的精準策略已在結(jié)直腸癌研究領(lǐng)域廣泛開展。然而,當前相關(guān)治療標準、指南絕大多數(shù)參考西方群體數(shù)據(jù)。為此,腫瘤醫(yī)院團隊展開基于中國人群的大規(guī)模結(jié)直腸癌特異性多基因檢測隊列研究。
探索化療敏感性差的謎題
繪制迄今國內(nèi)最大規(guī)模結(jié)直腸癌基因組變異圖譜
該研究基于中國人群結(jié)直腸腫瘤的前瞻性隊列,納入869例結(jié)直腸癌患者,其中包括586例早期和283例晚期結(jié)直腸癌。利用887基因Panel測序,繪制體系和胚系變異圖譜,描述了中國人群結(jié)直腸癌臨床病理和基因組變異特征。
這也是迄今國內(nèi)最大規(guī)模的結(jié)直腸癌前瞻性靶向測序平臺和臨床樣本隊列。
基因圖譜顯示,在結(jié)直腸癌體系變異方面,突變頻率前三位分別為TP53(72%)、APC(63%)和KRAS(42%),癌癥信號通路突變圖譜與高加索人群相比差異較大,呈現(xiàn)出中國結(jié)直腸癌患者群體的獨有特征。在胚系變異方面,4.6%的患者攜帶DNA損傷修復通路相關(guān)的明確致病或可能致病性胚系突變,其中27.5%易感基因攜帶者發(fā)生因雜合性缺失或雙等位基因變異導致的“二次打擊”事件。
此外,研究結(jié)果表明,BRAF和RBM10單基因驅(qū)動突變是轉(zhuǎn)移性結(jié)直腸癌較短無進展生存期的獨立預后因素,且體外實驗表明RBM10表達缺失促進腫瘤細胞增殖、遷移并抑制凋亡。胡欣教授說:“這可能是導致結(jié)直腸癌復發(fā)轉(zhuǎn)移的誘因之一!
基因組變異互作網(wǎng)絡(luò)分析共獲得65個共現(xiàn)和106個互斥潛在功能依賴性事件,其中KRAS/AMER1和KRAS/APC共現(xiàn)突變可加速藥物代謝,導致對以化療為基石的治療敏感性較差,從而使得患者在進行化療時臨床獲益有限。
發(fā)現(xiàn)“冷、熱”免疫微環(huán)境差異
優(yōu)化結(jié)直腸癌免疫治療療效預測機制
團隊發(fā)現(xiàn),聯(lián)合基因組標志物可優(yōu)化免疫治療療效預測,且這種預測在本中心免疫檢查點抑制劑治療隊列中得到驗證。比如,微衛(wèi)星高度不穩(wěn)定且插入缺失變異高負荷的腫瘤,在接受免疫治療后完全退縮,展現(xiàn)“熱”免疫微環(huán)境特征,其高免疫原性腫瘤新抗原經(jīng)MHC-II復合物遞呈給CD4+ T細胞,而激活細胞毒效應。
相反,POLE功能性突變攜帶者接受免疫治療后,疾病發(fā)生進展,盡管有極高的腫瘤突變負荷,但大量由非同義單核苷酸變異衍生新抗原的遞呈功能缺陷并多發(fā)耗竭,伴隨相對較少活化淋巴細胞浸潤、免疫檢查點表達及PD-1/PD-L1共定位等,整體呈現(xiàn)相對“冷”免疫表型。
“這一發(fā)現(xiàn)提示我們可以據(jù)此優(yōu)化預測免疫治療療效的基因組標志物,更精準識別獲益人群,為廣大結(jié)直腸癌患者的精準診療提供新希望”。徐燁教授表示。
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