
新冠病毒的溯源研究不僅是重要的科學問題,也是全球關(guān)注的熱點。近日,中國科學院微生物研究所王奇慧研究員,聯(lián)合中國科學院北京基因組研究所(國家生物信息中心)陳華研究員,中國科學院微生物研究所施一研究員,中國科學院西雙版納熱帶植物園Alice C. Hughes副研究員,中國疾病預(yù)防控制中心病毒病預(yù)防控制所劉軍研究員,清華大學環(huán)境學院蔣靖坤教授,中國疾病預(yù)防控制中心主任、中國科學院微生物研究所高福院士,中國科學院北京基因組研究所(國家生物信息中心)薛勇彪研究員,以及北京化工大學童貽剛教授在Cell Research雜志發(fā)表研究亮點文章,回顧歷史上重要病毒的溯源經(jīng)驗與發(fā)現(xiàn),總結(jié)新冠病毒的溯源研究進展,為新冠病毒的科學溯源研究提供了重要思路。
新發(fā)和再發(fā)傳染病是對全球健康、經(jīng)濟和安全的重大威脅。自SARS和MERS冠狀病毒引發(fā)疫情以來,在實驗數(shù)據(jù)和病毒傳播規(guī)律的相關(guān)研究支持下,科學界已經(jīng)普遍認為下一次由冠狀病毒引發(fā)疫情只是時間問題。
為有效改變這種趨勢,應(yīng)對未來的新發(fā)傳染病,研究新發(fā)現(xiàn)病原體的源頭和中間宿主十分必要。
以過去人類與冠狀病毒、流感病毒、艾滋病毒等的“戰(zhàn)疫”歷史為鑒,研究人員指出,新冠病毒溯源的科學研究需要關(guān)注:尋找到具有相關(guān)地理和生態(tài)關(guān)聯(lián)的宿主,需要積累大量的數(shù)據(jù),同時也要謹記暴發(fā)地不等于起源地。
目前,全球范圍內(nèi)多項研究表明:中國、柬埔寨、日本、泰國、英國、保加利亞、肯尼亞等地的菊頭蝠均攜帶新冠相關(guān)冠狀病毒,提示這類蝙蝠可能是新冠病毒的自然宿主。
其中,蝙蝠冠狀病毒RaTG13與新冠病毒基因組相似性為96.2%。但是,在序列方面,RaTG13與新冠病毒仍相差1100多個堿基。
高福院士與王奇慧、齊建勛等團隊合作,于2021年5月24日發(fā)表Cell 文章,指出在結(jié)合受體的特征以及宿主范圍方面,RaTG13與新冠病毒具有顯著差距。結(jié)合序列分析,說明RaTG13不是新冠病毒的直接祖先,二者具有共同祖先。
目前研究提示穿山甲是可能的中間宿主之一,穿山甲中至少存在兩種新冠相關(guān)冠狀病毒GX/P2V/2017以及GD/1/2019。
水貂也可能是中間宿主,它是唯一已知的暴發(fā)新冠疫情的動物,而且水貂中傳播的新冠病毒又發(fā)生了感染人事件,提示新冠病毒在水貂中的感染和傳播具有良好的適應(yīng)性,因此水貂可能在新冠病毒的演化中發(fā)揮了作用。
依據(jù)“戰(zhàn)疫”經(jīng)驗,新冠病毒從自然宿主到中間宿主的傳播,需要兩種宿主地理接近,并具有生態(tài)聯(lián)系。研究人員選取了菊頭蝠、穿山甲和水貂進行進一步分析。
通過對98種菊頭蝠、8種穿山甲以及歐洲水貂的全球分布區(qū)域進行分析,結(jié)合全球多地新冠相關(guān)冠狀病毒的檢出情況,研究人員提出,包括東南亞、中國南部、南亞、歐洲,以及撒哈拉以南非洲在內(nèi)的全球多個地點,均是冠狀病毒進化的熱點地區(qū),可能在新冠病毒的演化中發(fā)揮作用。因此,需要對這些地點的冠狀病毒進行檢測與監(jiān)測,才有可能找到新冠病毒的源頭。
另外,通過進化分析,作者認為早期新冠病毒序列主要分為兩類,而武漢華南海鮮市場的新冠病毒屬于出現(xiàn)時間較晚的一類。
因此,華南海鮮市場中的新冠病毒可能來自于其他地方。武漢作為一個國際化城市,在疫情之前世界各地的航班飛來這里,特別是東南亞地區(qū)的客運和貨運航班。其中,很多東南亞航班的出發(fā)地就有菊頭蝠和穿山甲。這些菊頭蝠就攜帶新冠相關(guān)冠狀病毒。
WHO-中國溯源聯(lián)合報告也認為,通過冷鏈/食品鏈引入新冠病毒的可能性是存在的。武漢在新冠疫情暴發(fā)之前就具有通過冷鏈引入新冠病毒的風險。
在本研究發(fā)表的同時,新證據(jù)不斷出現(xiàn),例如美國的白尾鹿中檢測出了新冠病毒的抗體,老撾的菊頭蝠中發(fā)現(xiàn)了比RaTG13更接近新冠病毒的冠狀病毒(96.8%)。
因此,正如對流感病毒、艾滋病毒等溯源一樣,對新冠病毒的溯源需要長期的、耐心的科學研究,需要全球科學家廣泛合作和共同努力,積累大量的數(shù)據(jù),才有可能判定新冠病毒的源頭、中間宿主和傳播途徑。
(來源:中國生物技術(shù)網(wǎng))
原文出處:Wang Q, Chen H, Shi Y, Hughes AC, Liu WJ, Jiang J, Gao GF, Xue Y, Tong Y. Tracing the origins of SARS-CoV-2: lessons learned from the past. Cell Res. 2021 Sep 29:1–3. doi: 10.1038/s41422-021-00575-w. Epub ahead of print. PMID: 34588626; PMCID: PMC8480455.
鏈接:https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/34588626/
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